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Enregistrement W2142647237 · doi:10.1017/s0024282909008111

Genetically divergent algae shape an epiphytic lichen community on Jack Pine in Manitoba

2009· article· en· W2142647237 sur OpenAlexaffabout
Matthew Doering, Michele D. Piercey‐Normore

Notice bibliographique

RevueThe Lichenologist · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLichen and fungal ecology
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLichenBiologyAlgaeBiological dispersalEpiphyteInternal transcribed spacerBotanyGene flowEcologyHabitatRibosomal DNARibosomal RNAPhylogeneticsGenetic variationGenePopulationGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Algal genotypes should freely associate with different lichen fungi that grow in the same confined habitat giving the appearance of low levels of selectivity and specificity. If genetic compatibility between algal and fungal partners limits the combination of partners, then some degree of taxonomic specificity should be evident. This study examined the photobiont composition in a community of epiphytic lichens on Jack Pine to investigate selectivity and specificity. The objectives of the study were to infer algal identity, to infer photobiont dispersal, and to investigate the distribution of algal genotypes relative to the fungal partner. Photobiont variability was determined by Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) and nucleotide sequences of the Internal Transcribed Spacer (ITS) of ribosomal DNA (rDNA). Seven species of lichen-forming fungi are reported to associate with five divergent algal genotypes, with only one species,Evernia mesomorpha, showing some degree of selectivity and specificity. The algae represent at least two species (Trebouxia jamesiiandT. impressa) for the area confined to 200cm2on the north side of 20 Jack Pine trees. Gene flow was inferred in this tightly defined community of lichenized algae. The algal sharing and inferred gene flow may suggest that soredia provide a means of algal transport and distribution among lichen-forming fungi in the habitat.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,921
Score d'incertitude au seuil0,156

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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