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Enregistrement W2142897074 · doi:10.1139/b99-185

Small subunit rDNA phylogeny shows the lichen families Caliciaceae and Physciaceae (Lecanorales, Ascomycotina) to form a monophyletic group

2000· article· en· W2142897074 sur OpenAlexvenueno aff
Mats Wedin, Heidi Döring, Anders Nordin, Leif Tibell

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Botany · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLichen and fungal ecology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMonophylyBiologyPhylogenetic treeLichenBotanyPhylogeneticsSystematicsEvolutionary biologyZoologyTaxonomy (biology)CladeGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A phylogenetic analysis based on small subunit (SSU) rDNA sequences shows the lecanoralean lichen families Caliciaceae and Physciaceae form a well-supported monophyletic group within the order Lecanorales (Ascomycotina). Support for this relationship is present from anatomical data, in particular data from spore ontogeny, where close similarities between the pattern of development of spore surface structures in the two families are pointed out. The Caliciaceae-Physciaceae group is characterized by having thick-walled, pigmented spores, often with a distinctive ornamentation which is usually formed either from strongly melanized parts of the perispore, separated by nonmelanized, gelatinous parts that eventually dissolve, or by cracks in the perispore. The relationship to the Teloschistaceae, sometimes suggested as a possible sister-group to the Physciaceae, was not supported by jackknifing, but cannot be rejected with the present data. There is no support for the suggested order Teloschistales. A brief discussion of the evolution of the prototunicate ascus in the Lecanorales is given. New SSU rDNA sequences were produced from Buellia disciformis (Fr.) Mudd. and Physcia aipolia (Humb.) Fürnr. (Physciaceae), Cladonia sulphurina (Michx.) Fr. (Cladoniaceae), Cyphelium tigillare (Ach.) Ach. (Caliciaceae), and Caloplaca flavorubescens (Huds.) J.R. Laundon and Xanthoria parietina (L.) Th.Fr. (Teloschistaceae).Key words: 18S, fungi, lichens, molecular phylogeny, ribosomal DNA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,725
Score d'incertitude au seuil0,994

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,177
Écart entre enseignants0,162 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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