Serial Analysis of Gene Expression Reveals Conserved Links between Protein Kinase A, Ribosome Biogenesis, and Phosphate Metabolism in <i>Ustilago maydis</i>
Notice bibliographique
Résumé
The switch from budding to filamentous growth is a key aspect of invasive growth and virulence for the fungal phytopathogen Ustilago maydis. The cyclic AMP (cAMP) signaling pathway regulates dimorphism in U. maydis, as demonstrated by the phenotypes of mutants with defects in protein kinase A (PKA). Specifically, a mutant lacking the regulatory subunit of PKA encoded by the ubc1 gene displays a multiple-budded phenotype and fails to incite disease symptoms, although proliferation does occur in the plant host. A mutant with a defect in a catalytic subunit of PKA, encoded by adr1, has a constitutively filamentous phenotype and is nonpathogenic. We employed serial analysis of gene expression to examine the transcriptomes of a wild-type strain and the ubc1 and adr1 mutants to further define the role of PKA in U. maydis. The mutants displayed changes in the transcript levels for genes encoding ribosomal proteins, genes regulated by the b mating-type proteins, and genes for metabolic functions. Importantly, the ubc1 mutant displayed elevated transcript levels for genes involved in phosphate acquisition and storage, thus revealing a connection between cAMP and phosphate metabolism. Further experimentation indicated a phosphate storage defect and elevated acid phosphatase activity for the ubc1 mutant. Elevated phosphate levels in culture media also enhanced the filamentous growth of wild-type cells in response to lipids, a finding consistent with PKA regulation of morphogenesis in U. maydis. Overall, these findings extend our understanding of cAMP signaling in U. maydis and reveal a link between phosphate metabolism and morphogenesis.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».