The role of the carboxyl terminal ?-helical coiled-coil domain in osmosensing by transporter ProP ofEscherichia coli
Notice bibliographique
Résumé
Concentrative uptake of osmoprotectants via transporter ProP contributes to the rehydration of Escherichia coli cells that encounter high osmolality media. A member of the major facilitator superfamily, ProP is activated by osmotic upshifts in whole bacteria, in cytoplasmic membrane vesicles and in proteoliposomes prepared with the purified protein. Soluble protein ProQ is also required for full osmotic activation of ProP in vivo. ProP is differentiated from structural and functional homologues by its osmotic activation and its C-terminal extension, which is predicted to form an alpha-helical coiled-coil. A synthetic polypeptide corresponding to the C-terminus of ProP (ProP-p) formed a dimeric alpha-helical coiled-coil. A derivative of transporter ProP lacking 26 C-terminal amino acids was expressed but inactive. A derivative harbouring amino acid changes K460I, Y467I and H495I (each at the core, coiled-coil 'a' position) required a larger osmotic upshift for activation than did the wild type transporter. The same changes extended, stabilized and altered the oligomeric state of the coiled-coil formed by ProP-p. Amino acid change R488I (also at the 'a' position) further increased the magnitude of the osmotic upshift required to activate ProP, reduced the activity attained and rendered ProP activation transient. Unexpectedly, replacement R488I destabilized the coiled-coil formed by ProP-p. The activity and osmotic activation of ProP were even more strongly attenuated by helix-destabilizing change I474P. These data demonstrate that the carboxyl terminal domain of ProP can form a homodimeric alpha-helical coiled-coil with unusual properties. They implicate the C-terminal domain in the osmotic activation of ProP.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».