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Enregistrement W2143625465 · doi:10.1038/nature11582

Host–microbe interactions have shaped the genetic architecture of inflammatory bowel disease

2012· review· en· W2143625465 sur OpenAlexaff
Luke Jostins, Stephan Ripke, Rinse K. Weersma, Richard H. Duerr, Dermot McGovern, Ken Hui, James Lee, L. Philip Schumm, Yashoda Sharma, Carl A. Anderson, Jonah Essers, Mitja Mitrovič, Kaida Ning, Isabelle Cleynen, Emilie Théâtre, Sarah L. Spain, Soumya Raychaudhuri, Philippe Goyette, Zhi Wei, Clara Abraham, Jean–Paul Achkar, Tariq Ahmad, Leila Amininejad, Ashwin N. Ananthakrishnan, Vibeke Andersen, Jane M. Andrews, Leonard Baidoo, Tobias Balschun, Peter A. Bampton, Alain Bitton, Gabrielle Boucher, Stephan Brand, Carsten Büning, Ariella Cohain, Sven Cichon, Mauro D’Amato, Dirk de Jong, Kathy L. Devaney, Marla C. Dubinsky, Cathryn Edwards, David Ellinghaus, Lynnette Ferguson, Denis Franchimont, Karin Fransén, Richard B. Gearry, Michel Georges, Christian Gieger, Jürgen Glas, Talin Haritunians, Ailsa Hart, Chris Hawkey, Matija Hedl, Xinli Hu, Tom H. Karlsen, Limas Kupčinskas, Subra Kugathasan, Anna Latiano, Debby Laukens, Ian C. Lawrance, Charlie W. Lees, Édouard Louis, Gillian Mahy, John Mansfield, Craig Mowat, William G. Newman, Orazio Palmieri, Cyriel Y. Ponsioen, Uroš Potočnik, Natalie J. Prescott, Miguel Regueiro, Jerome I. Rotter, Richard K. Russell, Jeremy Sanderson, Miquel Sans, Jack Satsangi, Stefan Schreiber, Lisa A. Simms, Jurgita Šventoraitytė, Stephan R. Targan, Kent D. Taylor, Mark Tremelling, Hein W. Verspaget, Cisca Wijmenga, David C. Wilson, Juliane Winkelmann, Ramnik J. Xavier, Sebastian Zeißig, Bin Zhang, Hu Zhang, Hongyu Zhao, Mark S. Silverberg, Vito Annese, Håkon Håkonarson, Steven R. Brant, Graham Radford‐Smith, Christopher G. Mathew, John D. Rioux, Eric E. Schadt, Mark J. Daly, André Franke, Miles Parkes, Séverine Vermeire, Jeffrey C. Barrett, Judy H. Cho

Notice bibliographique

RevueNature · 2012
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensMount Sinai HospitalMcGill University Health CentreRoyal Victoria Regional Health CentreUniversité de MontréalUniversity of TorontoRoyal Victoria HospitalMontreal Heart Institute
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteHelmholtz Zentrum MünchenNational Health and Medical Research CouncilInflammatory Bowel and Immunobiology Research InstituteNational Center for Research ResourcesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesVersus ArthritisNational Institutes of HealthSvenska LäkaresällskapetKarolinska InstitutetCrohn's and Colitis UKMinistero della SaluteDiabetes UKFonds Wetenschappelijk OnderzoekU.S. Public Health ServiceNational Human Genome Research InstituteFonds De La Recherche Scientifique - FNRSNational Institute for Health and Care ResearchBundesministerium für Bildung und ForschungCedars-Sinai Medical CenterDeutsche ForschungsgemeinschaftUniversitetssjukhuset ÖrebroKing's College LondonCrohn's and Colitis Foundation of AmericaNational Institute of General Medical SciencesCrohn's and Colitis FoundationMünchner Zentrum für GesundheitswissenschaftenExzellenzclusters EntzündungsforschungBritish Heart FoundationWellcome TrustNational Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesÖrebro UniversitetNational Center for Advancing Translational SciencesMedical Research CouncilLeona M. and Harry B. Helmsley Charitable Trust
Mots-clésInflammatory bowel diseaseHost (biology)DiseaseInflammatory Bowel DiseasesGenetic architectureBiologyMedicineGeneticsPathologyGenePhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4 859
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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