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Enregistrement W2143683483 · doi:10.1016/j.molonc.2009.07.002

Transcription factors down‐stream of Ras as molecular indicators for targeting malignancies with oncolytic herpes virus

2009· article· en· W2143683483 sur OpenAlexaff
Tuba Esfandyari, Ayalew Tefferi, Anna Szmidt, Tommy Alain, Pawel Zwolak, Terra L. Lasho, Patrick W. Lee, Faris Farassati

Notice bibliographique

RevueMolecular Oncology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVirus-based gene therapy research
Établissements canadiensDalhousie UniversityUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesFlight Attendant Medical Research Institute
Mots-clésOncolytic virusBiologyMAPK/ERK pathwayTranscription factorCancer researchJurkat cellsCancer cellPermissivenessEffectorKinaseRaji cellLymphomaVirologyCell biologyCancerGeneImmunologyVirusGeneticsViral replicationT cellImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Overactivation in Ras signaling has been under intensive study as the molecular basis for development of cancer. Such overactivation can occur in the presence or absence of mutations in Ras gene resulting in activation of a series of down-stream effectors such as transcription factors. Different studies have shown the activation of Ras down-stream effectors in non-Hodgkin lymphoma (NHL) although mutations in Ras are not prevalent in this malignancy. Since overactivation in Ras signaling also increases permissiveness of cancer cells to infection by oncolytic versions of herpes simplex virus (e.g. R3616), we were interested in evaluating the value of transcription factors down-stream of Ras as molecular indicators for permissiveness to herpes therapy. In order to accomplish this, and also to assess the permissiveness of lymphoma cells to infection with R3616, we used NHL cell lines Daudi, Jurkat, NC37, Raji, Ramos and ST486. Once the levels of phosphorylation (activation) of extracellular-signal regulated kinase (ERK, a Ras effector pathway) and its down-stream transcription factor ELK were evaluated, Raji and NC37 showed a significant increase in the phosphorylation levels of both molecules while ATF2 (another transcription factor down-stream of p38-kinase pathway) seemed to be activated in all studied cells. Raji and NC37 cells were also most permissive cells to infection with R3616 while their permissiveness was decreased upon treatment of cells with an inhibitor of ELK-DNA binding portraying ERK/ELK as a suitable predictive indicator for selection of cancer cells with increased sensitivity to R3616. This study, therefore, for the first time documents permissiveness of lymphoma cells to oncolytic herpes viruses and introduces ELK as a suitable factor for predicting tumor susceptibility to these novel anticancer agents.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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