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Enregistrement W2143694209 · doi:10.1093/hmg/ddl421

The epilepsy gene LGI1 encodes a secreted glycoprotein that binds to the cell surface

2006· article· en· W2143694209 sur OpenAlexaff
Ma Salomé Sirerol-Piquer, Ana Ayerdi-Izquierdo, José Manuel Morante‐Redolat, Vicente Herranz‐Pérez, Kristy Favell, Philip A. Barker, Jordi Pérez‐Tur

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGolgi apparatusGene isoformEndoplasmic reticulumGlycoproteinSecretionCell biologyExtracellularSecretory proteinSecretory pathwayIntracellularMutantGlycosylationGeneMolecular biologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Autosomal dominant lateral temporal epilepsy (ADTLE) is a partial epilepsy caused by mutations in LGI1, a multidomain protein of unknown function. To begin to understand the biological function of LGI1, we have determined its pattern of glycosylation, subcellular expression and capacity for secretion. LGI1 is expressed as two different isoforms in the brain, and we show that the long isoform is a secreted protein, whereas the short isoform is retained in an intracellular pool. ADLTE-related mutants of the long form are defective for secretion and are retained in the endoplasmic reticulum and Golgi complex. Finally, we show that normal secreted LGI1 specifically binds to the cell surface of differentiated PC12 cells. We propose that LGI1 is a secreted factor important for neuronal development and that ADTLE is a disease that results from the loss of regulation in the protein available either extracellular or intracellularly.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,113
Score d'incertitude au seuil0,929

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations114
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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