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Enregistrement W2143908316 · doi:10.1158/1078-0432.ccr-06-0030

Aberrant Expression of Collagen Triple Helix Repeat Containing 1 in Human Solid Cancers

2006· article· en· W2143908316 sur OpenAlexaff
Liren Tang, Derek L. Dai, Mingwan Su, Magdalena Martinka, Gang Li, Youwen Zhou

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueWnt/β-catenin signaling in development and cancer
Établissements canadiensSKiN HealthVancouver Coastal Health Research InstituteUniversity of British ColumbiaQuest University CanadaVancouver Coastal Health
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMelanomaCancerCarcinogenesisMedicineCancer researchImmunohistochemistryMetastasisPathologyBreast cancerPancreatic cancerBiologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: The collagen triple helix repeat containing 1 (CTHRC1) is a promigratory protein first found to be expressed during rat tissue repair process. Recent preliminary results revealed CTHRC(1) mRNA in melanoma and breast cancer. However, the full significance of CTHRC1 to human carcinogenesis remains unclear. This study is to further characterize the clinical and functional relevance of CTHRC1 in melanoma and other human solid cancers. EXPERIMENTAL DESIGN: First, semiquantitative immunohistochemistry analysis was done on 304 clinically annotated, paraffin-embedded biopsies representing different stages of melanoma progression. Then, short interfering RNA was used to inhibit expression of CTHRC1 protein for migration analysis on cultured melanoma cells. Finally, the CTHRC1 expression was surveyed in 310 samples representing 19 types of human solid cancers. RESULTS: In benign nevi and noninvasive melanoma biopsies, there was little CTHRC1 protein expression. In contrast, in invasive primary melanomas, there was a significant increase of CTHRC1 protein (P < 0.01, chi(2) test). There was a further increase of CTHRC1 protein in metastatic melanoma specimens compared with nonmetastatic lesions (P < 0.01, chi(2) test). In addition, inhibition of CTHRC1 expression resulted in decreased cell migration in vitro. Finally, transcription survey in 19 types of human solid cancers revealed aberrant CTHRC1 expression in 16 cancer types, especially cancers of the gastrointestinal tract, lung, breast, thyroid, ovarian, cervix, liver, and the pancreas. CONCLUSIONS: Aberrant expression of CTHRC1 is widely present in human solid cancers and seems to be associated with cancer tissue invasion and metastasis. It potentially plays important functional roles in cancer progression, perhaps by increasing cancer cell migration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,118
Tête enseignante GPT0,478
Écart entre enseignants0,359 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations152
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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