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Enregistrement W2144072833 · doi:10.1017/s0024282909990569

Convergent evolution in <i>Cladonia gracilis</i> and allies

2010· article· en· W2144072833 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueThe Lichenologist · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLichen and fungal ecology
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyMonophylyMaximum parsimonyInternal transcribed spacerPhylogenetic treeSubspeciesPhylogeneticsCladoniaEvolutionary biologyBotanyZoologyGeneticsCladeGeneLichen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Members of the Cladonia gracilis group of lichen fungi are common terrestrial lichens where morphological features are more similar between members of the C. gracilis species complex and allied species outside the complex than they are between subspecies within the complex. The objectives of this study were to examine whether the Cladonia gracilis species complex is monophyletic, to determine whether morphological similarity is supported by genetic variation, and to examine the utility of the polyketide synthase (PKS) gene for phylogenetic studies among closely related species. Two loci, the ketosynthase region of the PKS gene and the internal transcribed spacer (ITS) region of nuclear ribosomal DNA, were sequenced and analysed by Maximum Parsimony, Bayesian and haplotype network analyses. Functional differences were also inferred through ITS2 RNA secondary structures and non-synonymous changes in translated PKS amino acid sequences. The monophyly of the C. gracilis complex is supported by 71% bootstrap in the ITS phylogeny, and 92% bootstrap with greater than 95% posterior probability in the PKS phylogeny. Morphological similarity is not always supported by genetic similarity. The PKS gene is less variable than the ITS but the PKS supports species hypotheses that are reflected in the ITS2 RNA model. We conclude that monophyly of the C. gracilis complex can be supported if C. cornuta, C. coniocraea and C. ochrochlora are included in the complex. In addition, C. maxima , C. phyllophora and C. subchordalis are supported as monophyletic species outside the C. gracilis complex. Cladonia maxima may form a separate species and variation among podetial morphology may be explained by convergent evolution.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,590
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,195
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle