<i>Cladonia pyxidata</i>and<i>C. pocillum</i>; genetic evidence to regard them as conspecific
Notice bibliographique
Résumé
Species delimitation in lichen-forming fungi has been based largely on morphological differences of fungal structures and the lichen thallus with an assumption that morphology reflects hereditary changes. One of the distinguishing features between Cladonia pyxidata and C. pocillum (Cladoniaceae, Ascomycotina) is the shape of the primary squamules. Because these species may inhabit different types of soil the phylogeny of these species was examined in light of potential environmental influences from soil pH and photobiont. Samples were collected across North America, and soil pH was measured for a subset of samples. The nuclear ribosomal internal transcribed spacer of 49 fungal and 14 algal partners and a portion of the polyketide synthase gene of 18 fungi was sequenced and analyzed by phylogenetic methods. Restriction fragment length polymorphism (RFLP) profiles for 129 algae were examined for geographic variation and fungal specificity. Cladonia pyxidata and C. pocillum are not monophyletic but results show seven highly supported lineages. The photobiont and geographic distribution do not play a role in species delimitation. Soil pH shows a statistically significant difference between the extreme morphologies of the two species suggesting a possible link between morphology and environmental conditions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».