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Enregistrement W2144329580 · doi:10.1186/1477-5751-13-14

Reduction in hSOD1 copy number significantly impacts ALS phenotype presentation in G37R (line 29) mice: implications for the assessment of putative therapeutic agents

2014· article· en· W2144329580 sur OpenAlexafffund
Pierre Zwiegers, Grace Lee, Christopher A. Shaw

Notice bibliographique

RevueJournal of Negative Results in BioMedicine · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthALS Society of Canada
Mots-clésReduction (mathematics)PhenotypeBiologyLine (geometry)Presentation (obstetrics)Computational biologyGeneticsMedicineGeneMathematicsSurgery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: In vivo animal models of familial amyotrophic lateral sclerosis (fALS) are widely used to delineate the potential role that genetic mutations play in the neurodegenerative process. While these models are extensively used for establishing the safety and efficacy of putative therapeutics during pre-clinical development, effective clinical translation of pharmacological interventions has been largely unsuccessful. RESULTS: In this report we compare a recent cohort of G37R (line 29) mice generated from mating wild-type females with transgenic males obtained commercially to a previous set of offspring produced with transgenic male breeders from a colony established at a local collaborator's facility. Commercially derived progeny presented with a tightly clustered genomic signature for the mutant human superoxide dismutase1 transgene (hSOD1) locus, and exhibited a greater than two-fold reduction in the number of transgene copies present in the genome compared to offspring derived locally. Decrease in transgene levels corresponded with delayed ALS progression and a significant increase in overall lifespan (146%). CONCLUSIONS: These results highlight some key challenges inherent to the use of G37R (line 29) animals in pre-clinical studies for the development of ALS therapeutics. Without stringent assessment of mutant SOD1 copy number/protein levels, heterogeneity of transgene levels within cohorts may influence the behavioural and pathological presentation of disease and thus calls to question the validity of any detected therapeutic effects. Nuanced changes in mutant SOD1 copy number that currently remain unreported may undermine research endeavours, delay efforts for clinical translation, and compromise the rigor of animal studies by limiting reproducibility amongst research groups.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,084
Tête enseignante GPT0,453
Écart entre enseignants0,369 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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