Quantitative comparison of sarcomeric phosphoproteomes of neonatal and adult rat hearts
Notice bibliographique
Résumé
Neonatal hearts respond to stress and function in an environment quite different from adult hearts. There is evidence that these functional differences not only reflect modifications in the abundance and isoforms of sarcomeric proteins but also in the modulation of sarcomeric protein phosphorylation. Yet our understanding of changes in sarcomeric protein phosphorylation in development is incomplete. In the experiments reported here, we first quantified the intact sarcomeric protein phosphorylation status between neonatal and adult rat hearts by employing comparative two-dimensional (2-D) gel electrophoresis in conjunction with phosphoprotein-specific staining. Subsequently, we measured phosphorylation changes at the peptide level by employing high-resolution linear ion trap-Fourier transform (LTQ-FT) mass spectrometry analysis of titanium dioxide-enriched phosphopeptides differentially labeled with (16)O/(18)O during in-gel digestion. We also employed Western blot analysis using phosphorylation site-specific antibodies to measure phosphorylation changes. Our data demonstrated the novel finding that phosphorylation levels of myosin-binding protein C (MyBP-C) at Ser(295) and Ser(315) as well as tropomyosin at Ser(283) increased, whereas phosphorylation levels of MyBP-C at Ser(320) and myosin light chain 2 at Ser(15) decreased in neonatal hearts compared with the same sites in adult hearts. Although our data highlight the significant challenges in understanding relations between protein phosphorylation and cardiac function, they do support the hypothesis that developmental changes in the modulation of protein are functionally significant and correlate with the prevailing physiological state.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,002 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».