<i>Y</i>Not a Dead End: Epistatic Interactions Between<i>Y-</i>Linked Regulatory Polymorphisms and Genetic Background Affect Global Gene Expression in<i>Drosophila melanogaster</i>
Notice bibliographique
Résumé
The Y chromosome, inherited without meiotic recombination from father to son, carries relatively few genes in most species. This is consistent with predictions from evolutionary theory that nonrecombining chromosomes lack variation and degenerate rapidly. However, recent work has suggested a dynamic role for the Y chromosome in gene regulation, a finding with important implications for spermatogenesis and male fitness. We studied Y chromosomes from two populations of Drosophila melanogaster that had previously been shown to have major effects on the thermal tolerance of spermatogenesis. We show that these Y chromosomes differentially modify the expression of hundreds of autosomal and X-linked genes. Genes showing Y-linked regulatory variation (YRV) also show an association with immune response and pheromone detection. Indeed, genes located proximal to the euchromatin-heterochromatin boundary of the X chromosome appear particularly responsive to Y-linked variation, including a substantial number of odorant-binding genes. Furthermore, the data show significant regulatory interactions between the Y chromosome and the genetic background of autosomes and X chromosome. Altogether, our findings support the view that interpopulation, Y-linked regulatory polymorphisms can differentially modulate the expression of many genes important to male fitness, and they also point to complex interactions between the Y chromosome and genetic background affecting global gene expression.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».