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Enregistrement W2146411773 · doi:10.1007/s10552-014-0500-5

Associations of vitamin D pathway genes with circulating 25-hydroxyvitamin-D, 1,25-dihydroxyvitamin-D, and prostate cancer: a nested case–control study

2014· article· en· W2146411773 sur OpenAlexaff
Rebecca Gilbert, Carolina Bonilla, Chris Metcalfe, Sarah J. Lewis, David M. Evans, William D. Fraser, John P. Kemp, Jenny Donovan, Freddie C. Hamdy, David E. Neal, J. Athene Lane, George Davey Smith, Mark Lathrop, Richard M. Martin

Notice bibliographique

RevueCancer Causes & Control · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueVitamin D Research Studies
Établissements canadiensMcGill University and Génome Québec Innovation Centre
Organismes subventionnairesHealth Technology Assessment ProgrammeWorld Cancer Research FundUniversity of BristolNational Institute for Health and Care ResearchUniversity of CambridgeUniversity Hospitals Bristol NHS Foundation TrustCancer Research UKWellcome TrustNational Cancer Research InstituteMedical Research CouncilCancer Research Institute
Mots-clésProstate cancerVitamin D and neurologySingle-nucleotide polymorphismInternal medicineOdds ratioNested case-control studyCYP24A1Case-control studyMedicinevitamin D deficiencyProstateCalcitriol receptorVitamin D-binding proteinCancerOncologyEndocrinologyBiologyGeneGenotypeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Vitamin D pathway single nucleotide polymorphisms (SNPs) are potentially useful proxies for investigating whether circulating vitamin D metabolites [total 25-hydroxyvitamin-D, 25(OH)D; 1,25-dihydroxyvitamin, 1,25(OH)2D] are causally related to prostate cancer. We investigated associations of sixteen SNPs across seven genes with prostate-specific antigen-detected prostate cancer. METHODS: In a nested case-control study (within the ProtecT trial), we estimated odds ratios and 95 % confidence intervals (CIs) quantifying associations between SNPs and prostate cancer. Subgroup analyses investigated whether associations were stronger in men who had high/low sun exposure [a proxy for 25(OH)D]. We quantified associations of SNPs with stage (T1-T2/T3-T4) and grade (<7/≥7). Multiple variant scores included SNPs encoding proteins involved in 25(OH)D synthesis and metabolism. RESULTS: We included 1,275 prostate cancer cases (141 locally advanced, 385 high grades) and 2,062 healthy controls. Vitamin D-binding protein SNPs were associated with prostate cancer (rs4588-A: OR 1.20, CI 1.01, 1.41, p = 0.04; rs7041-T: OR 1.19, CI 1.02, 1.38, p = 0.03). Low 25(OH)D metabolism score was associated with high (vs low) grade (OR 0.76, CI 0.63, 0.93, p = 0.01); there was a similar association of its component variants: rs6013897-A in CYP24A1 (OR 0.78, CI 0.60, 1.01, p = 0.06) and rs10877012-T in CYP27B1 (OR 0.80, CI 0.63, 1.02, p = 0.07). There was no evidence that associations differed by level of sun exposure. CONCLUSION: We found some evidence that vitamin D pathway SNPs were associated with prostate cancer risk and grade, but not stage. There was no evidence of an association in men with deficient vitamin D (measured by having low sun exposure).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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