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Enregistrement W2146424165 · doi:10.1094/pdis-94-6-0782b

First Record of <i>Trichodorus primitivus</i> and Morphological and Molecular Identification of <i>Longidorus elongatus</i> from Canada

2010· article· en· W2146424165 sur OpenAlexaboutno aff
Majid Pedram, Gholamreza Niknam, R. T. Robbins, W. Decraemer, W Ye, Qibin Yu

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueNematode management and characterization studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologySponge spiculePoa pratensisNematologyNematodeBotanyVeterinary medicineAnatomyEcologyPoaceae

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

During July 2008, sandy loam soil samples were collected near the rhizosphere of Kentucky bluegrass (Poa pratensis L.) and tall fescue (Festuca arundinacea Schreb.) at a depth of 15 to 20 cm from Caledonia Park, Toronto, Canada. Samples were suspended in water and nematodes were collected on sieves with 250- and 74-μm openings. Among the nematodes recovered were one species of Longidorus Micoletzky, 1922 (4) and one species of Trichodorus Cobb, 1913. The Trichodorus species (2), was identified as T. primitivus (de Man, 1880) Micoletzky, 1922, in which females have rod-like sclerotized pieces parallel to the vagina lumen, each with dimensions of 3.1 × 1.2 μm and at a distance of 2 to 3 μm from each other; and males have spicules with a wide nonoffset capitulum and very narrow blade, three ventromedian cervical papillae (CP), and three precloacal supplements with the anterior one at the level of the capitulum of retracted spicules. Males showed unusual variation in the position of CP2 (i.e., posterior to the onchiostyle region, except for one specimen with CP2 located within the posterior onchiostyle region, which is typical for the species). The morphometric data for nine males are: L, 665 to 805 μm; a, 23.0 to 27.5; b, 3.7 to 5.2; c, 46 to 56; onchiostyle, 47 to 52 μm; and spicules, 32.5 to 40.5 μm. Measurements for 13 females are: L, 630 to 775 μm; a, 20.5 to 24.8; b, 3.5 to 5.5; c, 75.5 to 158.5; and V, 54 to 61%. To our knowledge, this is the first report of T. primitivus in Canada. According to Chen et al. (1), the Longidorus species was identified as L. elongatus (de Man, 1876) Micoletzky, 1922 (3). The morphometric data for females (n = 13) are: L, 5.1 to 6.0 mm; a, 78.5 to 106.5; b, 11.5 to 13.5; c, 86.0 to 120.5; V, 45.5 to 53.0%; odontostyle, 79 to 91 μm; odontophore, 57.5 to 66.5 μm; and tail length, 44.5 to 59.0 μm. Males were not found. Four juvenile stages were identified. J1 (n = 2) with a body length of 1.1, 1.2 mm and replacement/functional odontostyle 59, 59/53.5, 54.5 μm, J2 (n = 2) with L: 1.7, 2.0 mm and replacement/functional odontostyle 62.5, 68.0/58.7 μm, 59.0, J3 (n = 2): L: 2.8, 3.0 mm and replacement/functional odontostyle 76.5, 77/66.5, 67.0 μm and J4 (n = 2) with L: 3.6, 3.8 mm and replacement/functional odontostyle 87.0, 90.5/75.0, 77.5 μm. Due to large morphometric overlap in Longidorus species identification, 2,472 bp of the near full-length 18S and the internal transcribed spacer 1 region of rDNA (Accession No. GU199044) were sequenced. The Blastn search of the partial 18S revealed 100% identity with a population of L. elongatus from Scotland (GenBank No. AY687992, 1,707 bp compared), 99% identity (3 bp difference, 1,707 bp compared) with a population of L. elongatus from Iran (EU503141) and 99% identity (4 bp difference, 1,707 bp compared) with a population of L. elongatus (AF036594, sample location unknown). A Blastn search of the 18S and ITS region revealed only 1 to 3 bp differences with two populations of L. elongatus from Switzerland (AJ549986 and AJ549987) and a population of L. elongatus (AF511417) from Scotland. These molecular data further confirmed the identity of the population from Canada to be L. elongatus. References: (1) Q. Chen et al. Fundam. Appl. Nematol. 20:15, 1997. (2) W. Decraemer. Kluwer Academic Publishers, Dordrecht, the Netherlands, 1995. (3) J. G. de Man. Tijdschr. Ned. Dierk. Ver. 2:78, 1876. (4) H. Micoletzky. Archiv. Naturgesch. 87:1, 1922.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,682
Score d'incertitude au seuil0,983

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,173
Écart entre enseignants0,165 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2010
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