Ivermectin imposes selection pressure on P-glycoprotein from <i>Onchocerca volvulus</i>: linkage disequilibrium and genotype diversity
Notice bibliographique
Résumé
Widespread use of ivermectin (IVM) as part of the Onchocerciasis Control Program (OCP) in West Africa could influence the evolution of the human filarial parasite Onchocerca volvulus. Use of IVM, in some areas for 15 years, may have restricted genetic diversity of O. volvulus, resembling effects attributed to a population bottleneck. Large population-based chemotherapy programmes, such as the OCP, may impose strong selection pressure on parasites and an examination of possible genetic selection by IVM in O. volvulus is warranted. IVM is a substrate for P-glycoprotein; a homologue from O. volvulus (OvPGP) has been linked with IVM sensitivity. Linkage disequilibrium (LD) patterns of 28 genetic markers spanning the OvPGP locus were examined in 4 O. volvulus populations from the Volta Region of Ghana, West Africa. Reduced gene diversity, increased heterozygosity and an increase in the number of markers not in Hardy-Weinberg equilibrium were associated with increasing IVM treatment. The number of regions in LD decreased with treatment and with time. However, between 1999 and 2002, seven regions of OvPGP were always in complete LD, while surrounding areas showed a reduction in genetic variation. The use of IVM for onchocerciasis control has imposed strong selection on O. volvulus populations, reducing genetic variation and disrupting LD.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».