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A First Assessment of Mitochondrial DNA Variation and Geographic Distribution of Haplotypes in Hessian fly (Diptera: Cecidomyiidae)

2004· article· en· W2147040723 sur OpenAlexaboutno aff
Alisha J. Johnson, Brandon J. Schemerhorn, R. H. Shukle

Notice bibliographique

RevueAnnals of the Entomological Society of America · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInsect symbiosis and bacterial influences
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesPurdue UniversityU.S. Department of Agriculture
Mots-clésBiologyCecidomyiidaeHaplotypeMitochondrial DNAPopulationGeneticsMidgePhylogenetic treeEvolutionary biologyZoologyGallGeneEcologyGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Domain III of the mitochondrial 12S rRNA gene from Hessian fly, Mayetiola destructor (Say), was sequenced in 21 populations from the United States, two populations from Canada, five populations from the Mediterranean basin, one population from Southwest Asia, and one population from New Zealand. From the total alignment, seven unique mitochondrial DNA (mtDNA) sequences (haplotypes) were identified. Of the seven 12S haplotypes only three (haplotypes 1, 2, and 3) occurred in populations from North America, indicating these were most likely the introduced haplotypes. Haplotypes were not restricted to any given biotype of M. destructor as defined by virulence to resistance genes in wheat. Thus, neutral markers did not show structure based on biotype. Populations of M. destructor showed a predominance of one haplotype over the others in specific geographic regions. However, Wolbachia DNA was not detected in any population, indicating that inheritance patterns of mtDNA in M. destructor were most likely due to repeated bottlenecks leading to the expansion of one lineage over another. The complete complement of 12S sequences in the M. destructor populations was subjected to a phylogenetic reconstruction by using haplotypes 1 and 3 of the gall midge Orseolia oryzae (Wood-Mason), as outgroups. Results from this initial study indicate a more robust phylogenetic reconstruction and analysis of population history will test the hypothesis of a single introduction of M. destructor into North America.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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