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Enregistrement W2147432410 · doi:10.1111/j.1745-4581.2007.00105.x

DETECTION OF MULTIDRUG‐RESISTANT <i>SALMONELLA</i> TYPHIMURIUM DT104 IN POULTRY BY SELECTIVE ENRICHMENT AND CLOTH‐BASED HYBRIDIZATION ARRAY SYSTEM

2007· article· en· W2147432410 sur OpenAlexaff
Burton W. Blais, Amalia Martinez-Perez, Johanna Leggate, Martine Gauthier

Notice bibliographique

RevueJournal of Rapid Methods & Automation in Microbiology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensCanadian Food Inspection Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSalmonella entericaSalmonellaAmpliconBiologyMicrobiologyMultiple drug resistanceTetracyclineSwarming (honey bee)Polymerase chain reactionGeneBacteriaDrug resistanceAntibioticsGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT A rapid method was devised for the selective enrichment and detection of multi‐antibiotic‐resistant Salmonella enterica subsp. enterica serotype Typhimurium ( S. Typhimurium) DT104 in poultry. The target organism was pre‐enriched in trypticase soy broth supplemented with chloramphenicol, followed by plating on modified semisolid Rappaport Vassiliadis medium and sampling a portion of the swarming growth. The presence of S. Typhimurium DT104 was determined by testing the growth using a cloth‐based hybridization array system (CHAS) targeting antibiotic resistance and other marker genes associated with this organism. In this CHAS, a multiplex polymerase chain reaction incorporating digoxigenin–dUTP was used to simultaneously amplify seven target gene sequences, with subsequent rapid detection of the amplicons by hybridization with an array of probes immobilized on polyester cloth and immunoenzymatic assay of the bound label. This procedure permitted the rapid determination of S. Typhimurium DT104 in chicken carcass rinse, powdered egg and feed samples inoculated with different levels of the target organism. PRACTICAL APPLICATIONS The combined selective enrichment and CHAS procedure will enable the rapid screening of poultry and related products for the presence of multidrug resistant Salmonella Typhimurium DT104. The convenience of this approach lies in the fact that samples containing salmonellae requiring more comprehensive analysis can be rapidly identified on the basis of a simple preliminary enrichment procedure involving examination of MSRV plating media for characteristic swarming growth. The swarming growth is readily sampled and analyzed by the DT104 CHAS to determine the presence of key marker genes associated with the multidrug resistant pathogen, obviating the need for time‐ and labor‐consuming conventional purification and antimicrobial susceptibility testing procedures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,147
Score d'incertitude au seuil0,355

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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