MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2147465745 · doi:10.1371/journal.pone.0043099

Creation of an Open-Access, Mutation-Defined Fibroblast Resource for Neurological Disease Research

2012· article· en· W2147465745 sur OpenAlexaff
Selina Wray, Matthew W. Self, Patrick A. Lewis, Jan‐Willem Taanman, Natalie S. Ryan, Colin Mahoney, Yuying Liang, Michael J. Devine, Una‐Marie Sheerin, Henry Houlden, Huw R. Morris, Daniel G. Healy, J.F. Martí-Massó, Elisavet Preza, Suzanne Barker, Margaret Sutherland, Roderick A. Corriveau, Michael R. D’Andrea, Anthony H.V. Schapira, Ryan J. Uitti, Mark Guttman, Grzegorz Opala, Barbara Jasińska‐Myga, Andreas Puschmann, Christer Nilsson, Alberto J. Espay, Jarosław Sławek, Ludwig Gutmann, Bradley F. Boeve, Khrista Boylan, A. Jon Stoessl, Owen A. Ross, Nicholas J. Maragakis, Jay Van Gerpen, Melissa Gerstenhaber, Katrina Gwinn, Ted M. Dawson, Ole Isacson, Karen Marder, Lorraine N. Clark, Serge Przedborski, Steven Finkbeiner, Jeffrey D. Rothstein, Zbigniew K. Wszołek, Martin N. Rossor, John Hardy

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePluripotent Stem Cells Research
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaCentre for Movement Disorders
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeMedical Research CouncilUniversity of California, IrvineNational Institutes of HealthFeinberg School of MedicineAlzheimer's SocietyUniversity of SheffieldWellcome TrustUniversity College LondonCedars-Sinai Medical CenterUniversity at BuffaloUniversity of DundeeUniversity of PennsylvaniaHarvard UniversityNorthwestern UniversityMcLean HospitalParkinson's Disease FoundationMichael J. Fox Foundation for Parkinson's ResearchJohns Hopkins UniversityCardiff UniversityMayo ClinicParkinson's UKCHDI FoundationNational Institute for Health and Care ResearchMassachusetts General Hospital
Mots-clésDiseaseInduced pluripotent stem cellMutationMedicineBioinformaticsNeuroscienceBiologyGeneGeneticsPathologyEmbryonic stem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Our understanding of the molecular mechanisms of many neurological disorders has been greatly enhanced by the discovery of mutations in genes linked to familial forms of these diseases. These have facilitated the generation of cell and animal models that can be used to understand the underlying molecular pathology. Recently, there has been a surge of interest in the use of patient-derived cells, due to the development of induced pluripotent stem cells and their subsequent differentiation into neurons and glia. Access to patient cell lines carrying the relevant mutations is a limiting factor for many centres wishing to pursue this research. We have therefore generated an open-access collection of fibroblast lines from patients carrying mutations linked to neurological disease. These cell lines have been deposited in the National Institute for Neurological Disorders and Stroke (NINDS) Repository at the Coriell Institute for Medical Research and can be requested by any research group for use in in vitro disease modelling. There are currently 71 mutation-defined cell lines available for request from a wide range of neurological disorders and this collection will be continually expanded. This represents a significant resource that will advance the use of patient cells as disease models by the scientific community.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,068
Score d'incertitude au seuil0,329

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,144
Tête enseignante GPT0,387
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations141
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS ONEMême sujetPluripotent Stem Cells ResearchTravaux en français237 207