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Enregistrement W2147990519 · doi:10.1128/aac.44.11.3049-3054.2000

Fluoroquinolone Resistance in Clinical Isolates of <i>Streptococcus pneumoniae</i> : Contributions of Type II Topoisomerase Mutations and Efflux to Levels of Resistance

2000· article· en· W2147990519 sur OpenAlexafffund
Darrin J. Bast, Donald E. Low, Carla Duncan, Laurie Kilburn, Lionel A. Mandell, Ross Davidson, Joyce C. S. de Azavedo

Notice bibliographique

RevueAntimicrobial Agents and Chemotherapy · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePneumonia and Respiratory Infections
Établissements canadiensQueen Elizabeth II Health Sciences CentreUniversity Health NetworkUniversity of TorontoDalhousie UniversityHamilton Health SciencesMcMaster University
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilMedical Research Council Canada
Mots-clésEffluxCiprofloxacinBiologyMicrobiologyStreptococcus pneumoniaeTopoisomerase IVAmino acid substitutionQuinoloneAmino acidCross-resistanceStreptococcaceaeMutationDNA gyraseGeneticsGeneAntibioticsEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We report on amino acid substitutions in the quinolone resistance-determining region of type II topisomerases and the prevalence of reserpine-inhibited efflux for 70 clinical isolates of S. pneumoniae for which the ciprofloxacin MIC is >/=4 microgram/ml and 28 isolates for which the ciprofloxacin MIC is </=2 microgram/ml. The amino acid substitutions in ParC conferring low-level resistance (MICs, 4 to 8 microgram/ml) included Phe, Tyr, and Ala for Ser-79; Asn, Ala, Gly, Tyr, and Val for Asp-83; Asn for Asp-78; and Pro for Ala-115. Isolates with intermediate-level (MICs, 16 to 32 microgram/ml) and high-level (MICs, 64 microgram/ml) resistance harbored substitutions of Phe and Tyr for Ser-79 or Asn and Ala for Asp-83 in ParC and an additional substitution in GyrA which included either Glu-85-Lys (Gly) or Ser-81-Phe (Tyr). Glu-85-Lys was found exclusively in isolates with high-level resistance. Efflux contributed primarily to low-level resistance in isolates with or without an amino acid substitution in ParC. The impact of amino acid substitutions in ParE was minimal, and no substitutions in GyrB were identified.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,685
Score d'incertitude au seuil0,431

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations121
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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