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Enregistrement W2148050511 · doi:10.1093/jac/dki074

Increase in ampC promoter strength due to mutations and deletion of the attenuator in a clinical isolate of cefoxitin-resistant Escherichia coli as determined by RT–PCR

2005· article· en· W2148050511 sur OpenAlexaff
Dobryan M. Tracz, David A. Boyd, Louis Bryden, Romeo Hizon, Sandra Giercke, Paul Van Caeseele, Michael R. Mulvey

Notice bibliographique

RevueJournal of Antimicrobial Chemotherapy · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCefoxitinEscherichia coliAttenuator (electronics)MicrobiologyBiologyCeftizoximeEnterobacteriaceaeAntibioticsVirologyCephalosporinGeneGeneticsBacteriaStaphylococcus aureusPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: To characterize the mechanism of cefoxitin resistance in clinical isolate Escherichia coli N99-0001. METHODS: Plasmid analysis, PCR for beta-lactamases, and sequencing of the ampC genes was carried out. An RT-PCR method was developed to determine relative ampC expression. RESULTS: Analysis of the ampC promoter region of E. coli N99-0001 revealed a T-->A mutation at -32, a C-->A mutation at -11, an insertion of a T between -20 and -21, and a 28 bp deletion including the entire attenuator. RT-PCR showed that ampC was expressed 140-fold higher in E. coli N99-0001 than in E. coli ATCC 25922. CONCLUSIONS: Cefoxitin resistance in E. coli N99-0001 was due to overexpression of ampC caused by an increase in promoter strength.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,156
Score d'incertitude au seuil0,420

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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