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Enregistrement W2148644613 · doi:10.1373/clinchem.2015.239863

Validation of New Cancer Biomarkers: A Position Statement from the European Group on Tumor Markers

2015· review· en· W2148644613 sur OpenAlexaff
Michael J. Duffy, Catharine M. Sturgeon, György Sölétormos, Vivian Barak, Rafael Molina, Daniel F. Hayes, Eleftherios P. Diamandis, Patrick M. Bossuyt

Notice bibliographique

RevueClinical Chemistry · 2015
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesScience Foundation IrelandIrish Cancer SocietyNovartisFashion Footwear Association of New YorkAstraZenecaBreast Cancer Research Foundation
Mots-clésBiomarkerMedicineCancerCancer biomarkersBiomarker discoveryOncologyInternal medicineProteomicsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Biomarkers are playing increasingly important roles in the detection and management of patients with cancer. Despite an enormous number of publications on cancer biomarkers, few of these biomarkers are in widespread clinical use. CONTENT: In this review, we discuss the key steps in advancing a newly discovered cancer candidate biomarker from pilot studies to clinical application. Four main steps are necessary for a biomarker to reach the clinic: analytical validation of the biomarker assay, clinical validation of the biomarker test, demonstration of clinical value from performance of the biomarker test, and regulatory approval. In addition to these 4 steps, all biomarker studies should be reported in a detailed and transparent manner, using previously published checklists and guidelines. Finally, all biomarker studies relating to demonstration of clinical value should be registered before initiation of the study. SUMMARY: Application of the methodology outlined above should result in a more efficient and effective approach to the development of cancer biomarkers as well as the reporting of cancer biomarker studies. With rigorous application, all stakeholders, and especially patients, would be expected to benefit.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,033
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,017
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,033
Score d'incertitude au seuil0,175

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0330,017
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0050,003
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0030,004
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0080,009
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,170
Tête enseignante GPT0,446
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations138
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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