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Enregistrement W2149343688 · doi:10.1002/jrs.1552

Discrimination between UV radiation‐induced and thermally induced spectral changes in AT‐paired DNA oligomers using UV resonance Raman spectroscopy

2006· article· en· W2149343688 sur OpenAlexafffund
Andrew Jirasek, H. Georg Schulze, Curtis H. Hughesman, A. Louise Creagh, Charles A. Haynes, Michael W. Blades, Robin F. B. Turner

Notice bibliographique

RevueJournal of Raman Spectroscopy · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSpectroscopy Techniques in Biomedical and Chemical Research
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British ColumbiaUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésRaman spectroscopyResonance Raman spectroscopySpectroscopyChemistryUltravioletAnalytical Chemistry (journal)Ultraviolet visible spectroscopyThermal stabilityRadiationResonance (particle physics)Hydrogen bondPhotochemistryMaterials scienceMoleculeOptoelectronicsOpticsOrganic chemistryAtomic physics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Ultraviolet resonance Raman spectroscopy (UVRRS) was used to monitor UV radiation and thermal energy deposition in 12‐ and 18‐mer AT oligomers. Difference spectroscopy and two‐dimensional correlation spectroscopy (2DCOS) were used to characterize the distinct spectral responses manifested by the two processes, and to examine their potential cooperative and/or independent effects on the ensemble spectrum. Experiments utilizing incremental doses of 257‐nm radiation revealed that the most affected bands are those involving double bonds when the sample temperature was held constant. Complementary experiments utilizing sample heating indicated that the most affected bands were those involving hydrogen‐bond disruption. Finally, it is shown that bands associated with Watson–Crick hydrogen‐bond disruption are the most affected in rapidly heat‐cycled samples. The results also suggest that both radiation and thermal effects produce independent structural changes in AT oligomers and, furthermore, that these effects are complementary when the experiments involve single‐strand DNA fragments. When using UVRRS to study one of these perturbations (e.g. thermal stability of DNA), the concurrent perturbation (e.g. UV exposure) must not be neglected, since UV exposure is inherent in the UVRR process. These findings thus have implications for the use of UVRRS in the study of DNA dynamics. Copyright © 2006 John Wiley & Sons, Ltd.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,056
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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