High DNA-methyltransferase 3B expression predicts poor outcome in acute myeloid leukemia, especially among patients with co-occurring NPM1 and FLT3 mutations
Notice bibliographique
Résumé
DNA methyltransferases (DNMTs) are epigenetic regulators targeted to the treatment of hematological malignancies.1, 2, 3, 4 Mutations in the DNA methyltransferase DNMT3A and high expression of its paralogue DNMT3B have been associated with inferior outcome in acute myeloid leukemia (AML) and other hematological malignancies.5, 6, 7, 8 Using a publicly available gene expression data set,9 we studied whether DNMT3B expression correlates with outcome in genetically well-defined AML subgroups. We first validated the expression data from the microarray by quantitative PCR, using 39 patient samples (Supplementary Figure S1A). DNMT3B micro-array analyses showed that the expression was not normally distributed among AML patients; in the quartile with highest expression, a larger variation in expression was observed compared to the three quartiles with relatively lower expression (Supplementary Figure S1B). The median DNMT3B expression in AML samples was significantly lower compared with that observed in normal bone marrow (NBM)-derived CD34+ cells (P 60 years; white blood cell counts >100 × 109/l; transplantation status; karyotypes t(8;21), t(15;17) and inv(16); nucleophosmin 1 (NPM1), FLT3-ITD, DNMT3A and double CEBPA mutations, and ecotropic viral integration site 1 (EVI1) overexpression), which revealed that higher DNMT3B expression carried an independent prognostic risk for both OS and EFS (hazard ratio (HR): 1.768, 95% confidence interval (CI): 1.384–2.260; P<0.001 and HR: 1.706, 95% CI: 1.342–2.168; P<0.001, respectively, Table 1), in line with a recently published study.7 In fact, higher DNMT3B expression showed a higher hazard ratio for OS than that of well-known adverse prognostic factors such as internal tandem duplications of the fms-related tyrosine kinase 3 (FLT3-ITD, HR: 1.675, 95% CI: 1.287–2.179; P<0.001) and overexpression of the EVI1 gene (HR: 1.430, 95% CI: 0.999–2.047; P=0.051).
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,008 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».