MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2149736698 · doi:10.1093/carcin/bgu006

Integrin α6A splice variant regulates proliferation and the Wnt/β-catenin pathway in human colorectal cancer cells

2014· article· en· W2149736698 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueCarcinogenesis · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésWnt signaling pathwayGene knockdownBiologyCancer researchAlternative splicingCateninIntegrinGene silencingRNA splicingCell growthColorectal cancerspliceRNA interferenceSmall interfering RNACell biologyCell cultureMessenger RNAMolecular biologySignal transductionCellRNACancerGeneticsGeneTransfection

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The integrin α6 subunit pre-messenger RNA undergoes alternative splicing to generate two different splice variants, named α6A and α6B, having distinct cytoplasmic domains. In the human colonic gland, these splice variants display different patterns of expression suggesting specific functions for each variant. We have previously found an up-regulation of the α6β4 integrin in colon adenocarcinomas as well as an increase in the α6A/α6B ratio, but little is known about the involvement of α6Aβ4 versus α6Bβ4 in this context. The aim of this study was to elucidate the function of the α6Aβ4 integrin in human colorectal cancer (CRC) cells. Expression studies on a panel of primary CRCs confirmed that the up-regulation of the α6 subunit in CRC is a direct consequence of the increase of the α6A variant. To investigate the functional significance of an α6A up-regulation in CRC, we specifically knocked down its expression in well-established CRC cell lines using a small-hairpin RNA approach. Results showed a growth rate reduction in all α6A knockdown CRC cell lines studied. The α6A silencing was also found to be associated with a significant repression of a number of Wnt/β-catenin pathway end points. Moreover, it was accompanied by a reduction in the capacity of these cells to develop tumours in xenografts. Taken together, these results demonstrate that the α6A variant is a pro-proliferative form of the α6 integrin subunit in CRC cells and appears to mediate its effects through the Wnt/β-catenin pathway.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,084
Score d'incertitude au seuil0,456

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle