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Enregistrement W2149832383 · doi:10.1111/jbi.12042

Phylogeographical patterns in the widespread arctic–alpine plant <i>Bistorta vivipara</i> (Polygonaceae) with emphasis on western North America

2012· article· en· W2149832383 sur OpenAlexafffund
Kendrick L. Marr, Geraldine A. Allen, Richard J. Hebda, Laurie J. McCormick

Notice bibliographique

RevueJournal of Biogeography · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueClimate change and permafrost
Établissements canadiensUniversity of VictoriaRoyal British Columbia Museum
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyHaplotypeGenetic diversityPopulationRange (aeronautics)Genetic structureGenetic variationEcologyEvolutionary biologyZoologyGeographyGeneticsDemographyGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Aim We investigated genetic variation in Bistorta vivipara , a widespread Northern Hemisphere tundra species, to infer patterns of migration and where it may have survived during the Last Glacial Maximum ( LGM ). Location Samples came primarily from western North America, with a few from the Arctic and Eurasia. Methods We sequenced two chloroplast DNA spacer regions, trn H –psb A and trn S – G, in individuals from 199 populations and mapped haplotype distributions and their relationships using a haplotype network. We calculated genetic and molecular diversity statistics for the seven geographical regions from which we obtained samples. Results Fifteen haplotypes were detected, with very little divergence among them. The haplotypes are separated into two main groups by the presence or absence of a 22 bp tandem duplication. Four haplotypes are common, widespread and with substantial range overlap; 11 are rare and mostly unique to one region. Two rare haplotypes were found only in British Columbia ( BC ). Western North America and Asia have the highest levels of genetic and molecular diversity. Northern and southern BC have different haplotype complements. Main conclusions Bistorta vivipara has relatively low genetic diversity, with much less genetic structure than we expected for such a widespread species. We expected significant geographical structure due to the combined effects of genetic drift and geographical isolation. The asexual reproductive mode of B. vivipara may facilitate relatively rapid population establishment and spread compared with sexual reproduction by seed. Bistorta vivipara probably originated in Asia and spread to North America and Europe prior to the LGM . In western North America it spread to its modern distribution from Beringia and the western USA following the LGM . Populations in northern and southern BC may have different histories, possibly related to the timing and extent of glaciation. The occurrence of two unique haplotypes within BC suggests that some individuals may have survived in full glacial refugia within BC .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,029
Score d'incertitude au seuil0,983

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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