Phylogeographical patterns in the widespread arctic–alpine plant <i>Bistorta vivipara</i> (Polygonaceae) with emphasis on western North America
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Aim We investigated genetic variation in Bistorta vivipara, a widespread Northern Hemisphere tundra species, to infer patterns of migration and where it may have survived during the Last Glacial Maximum (LGM). Location Samples came primarily from western North America, with a few from the Arctic and Eurasia. Methods We sequenced two chloroplast DNA spacer regions, trnH–psbA and trnS–G, in individuals from 199 populations and mapped haplotype distributions and their relationships using a haplotype network. We calculated genetic and molecular diversity statistics for the seven geographical regions from which we obtained samples. Results Fifteen haplotypes were detected, with very little divergence among them. The haplotypes are separated into two main groups by the presence or absence of a 22 bp tandem duplication. Four haplotypes are common, widespread and with substantial range overlap; 11 are rare and mostly unique to one region. Two rare haplotypes were found only in British Columbia (BC). Western North America and Asia have the highest levels of genetic and molecular diversity. Northern and southern BC have different haplotype complements. Main conclusions Bistorta vivipara has relatively low genetic diversity, with much less genetic structure than we expected for such a widespread species. We expected significant geographical structure due to the combined effects of genetic drift and geographical isolation. The asexual reproductive mode of B. vivipara may facilitate relatively rapid population establishment and spread compared with sexual reproduction by seed. Bistorta vivipara probably originated in Asia and spread to North America and Europe prior to the LGM. In western North America it spread to its modern distribution from Beringia and the western USA following the LGM. Populations in northern and southern BC may have different histories, possibly related to the timing and extent of glaciation. The occurrence of two unique haplotypes within BC suggests that some individuals may have survived in full glacial refugia within BC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».