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Enregistrement W2149882720 · doi:10.1186/1476-4598-9-131

Quantitative analysis of the effect of tubulin isotype expression on sensitivity of cancer cell lines to a set of novel colchicine derivatives

2010· article· en· W2149882720 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueMolecular Cancer · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueSynthesis and biological activity
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteAllard FoundationAlberta Cancer FoundationMinistry of Advanced Education, Government of AlbertaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaU.S. Department of Defense
Mots-clésTubulinColchicineIsotypeBiologyMicrotubuleGene isoformCytotoxicityCancer cellCytotoxic T cellCancer researchCancerMolecular biologyCell biologyBiochemistryAntibodyImmunologyGeneticsIn vitroGeneMonoclonal antibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: A maximum entropy approach is proposed to predict the cytotoxic effects of a panel of colchicine derivatives in several human cancer cell lines. Data was obtained from cytotoxicity assays performed with 21 drug molecules from the same family of colchicine compounds and correlate these results with independent tubulin isoform expression measurements for several cancer cell lines. The maximum entropy method is then used in conjunction with computed relative binding energy values for each of the drug molecules against tubulin isotypes to which these compounds bind with different affinities. RESULTS: We have found by using our analysis that alphabetaI and alphabetaIII tubulin isoforms are the most important isoforms in establishing predictive response of cancer cell sensitivity to colchicine derivatives. However, since alphabetaI tubulin is widely distributed in the human body, targeting it would lead to severe adverse side effects. Consequently, we have identified tubulin isotype alphabetaIII as the most important molecular target for inhibition of microtubule polymerization and hence cancer cell cytotoxicity. Tubulin isotypes alphabetaI and alphabetaII are concluded to be secondary targets. CONCLUSIONS: The benefit of being able to correlate expression levels of specific tubulin isotypes and the resultant cell death effect is that it will enable us to better understand the origin of drug resistance and hence design optimal structures for the elimination of cancer cells. The conclusion of the study described herein identifies tubulin isotype alphabetaIII as a target for optimized chemotherapy drug design.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,404

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle