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Enregistrement W2150515181 · doi:10.1128/iai.70.5.2622-2629.2002

Construction and Characterization of an Acapsular Mutant of <i>Mannheimia haemolytica</i> A1

2002· article· en· W2150515181 sur OpenAlexafffund
Linda J. McKerral, Reggie Y.C. Lo

Notice bibliographique

RevueInfection and Immunity · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesUniversity of Guelph
Mots-clésBiologyMutantMicrobiologyMolecular biologyLipopolysaccharideGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The nmaA and nmaB genes, which code for UDP-GlcNAc-2-epimerase and UDP-ManNAc-dehydrogenase, respectively, are involved in capsular polysaccharide biosynthesis in Mannheimia haemolytica A1. A chloramphenicol resistance (Cm(r)) cassette cloned behind an M. haemolytica A1 promoter, plpcat, was created and used to interrupt nmaA and nmaB. A 1.3-kbp DNA fragment that encompasses part of nmaA and nmaB was replaced by the 1.0-kbp plpcat, resulting in a knockout mutant which is Cm(r) and unable to synthesize N-acetylmannosamine (ManNAc) and N-acetylmannosaminuronic acid (ManNAcA). The DNA replacement was confirmed by Southern hybridization and PCR analyses of the nmaA and nmaB loci. Electron microscopy examination of the mutant showed the absence of capsular materials compared to the parent strain. The loss of NmaA and NmaB activity was confirmed by analysis of carbohydrate moieties using capillary electrophoresis. Serum sensitivity assays indicated that the acapsular mutant is as resistant as the encapsulated parent to complement-mediated killing by colostrum-deprived calf serum but is more sensitive to killing by immune bovine serum. Analysis of lipopolysaccharide prepared from the acapsular mutant and encapsulated parent confirmed that these strains have long O-polysaccharide chains, possibly conferring resistance to serum-mediated killing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,199
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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