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Enregistrement W2150560229 · doi:10.1034/j.1399-3054.2000.100313.x

Effect of light quality and 5‐azacytidine on genomic methylation and stem elongation in two ecotypes of <i>Stellaria longipes</i>

2000· article· en· W2150560229 sur OpenAlexafffund
Gurminder S. Tatra, Jacintha Miranda, C. C. Chinnappa, David M. Reid

Notice bibliographique

RevuePhysiologia Plantarum · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésEcotypeBiologyElongationMethylationDemethylationBotanyDNA methylationHorticultureGene expressionGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Changes in cytosine methylation are known to occur in response to various environmental stimuli, therefore, we looked at methylation changes in relation to stem elongation. More specifically, we investigated the response of genomic cytosine methylation to irradiance‐mediated plasticity of stem elongation in two ecotypes of Stellaria longipes . Ramets of S. longipes were grown under high and low ratios of red/far‐red light (F/FR; 3.7 and 0.7, respectively). Stem elongation and methylated cytosine content were measured over a period of 7 days. Ramets of S. longipes demonstrated the highest level of demethylation after 4 days of long‐day warm (LDW) treatment, which coincides with the first day of rapid stem elongation initiation. The extent of demethylation associated with day 4 depended upon the relative ratio of R/FR light. In particular, those plants treated with low R/FR light ratios showed a lower level of methylation, and were taller than the high R/FR light grown counterparts. In addition, prairie ecotype plants demonstrated lower day 4 methylation levels, as well as longer day 7 stem lengths, than the alpine ecotype plants within the same R/FR light treatments. To investigate if the degree of methylation was a crucial factor in controlling the stem elongation response, ramets of both alpine and prairie plants were grown in MS media supplemented with 5‐azacytidine (5‐AzaC), and grown for 14 days under a R/FR ratio of 3.7 and two different PAR values. 5‐AzaC treatments demonstrated that the prairie ecotype plants required greater doses of 5‐AzaC, and thus lower methylation levels, than the alpine ecotype plants in order to promote maximal stem elongation. These observations suggest that DNA demethylation is involved in the shade‐avoidance response.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,534
Score d'incertitude au seuil0,181

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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