MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2150577437 · doi:10.1038/sj.bjc.6605338

COGENT (COlorectal cancer GENeTics): an international consortium to study the role of polymorphic variation on the risk of colorectal cancer

2009· article· en· W2150577437 sur OpenAlexafffund
Ian Tomlinson, Malcolm G. Dunlop, Harry Campbell, Brent W. Zanke, Steve Gallinger, Thomas J. Hudson, Thibaud Koessler, Paul D.P. Pharoah, I Niittymäkix, S Tuupanenx, Lauri A. Aaltonen, Kari Hemminki, Annika Lindblom, Asta Försti, Oliver M. Sieber, Lara Lipton, Tom van Wezel, Hans Morreau, Juul Wijnen, Peter Devilee, Koichi Matsuda, Yusuke Nakamura, Sergi Castellvı́-Bel, Clara Ruíz-Ponte, Antoni Castells, Ángel Carracedo, Judy Ho, Pak C. Sham, Robert M.W. Hofstra, Pavel Vodička, Hermann Brenner, Jochen Hampe, Clemens Schafmayer, Jürgen Tepel, Stefan Schreiber, Henry Völzke, Markus M. Lerch, Christian A. Schmidt, Stephan Buch, Vı́ctor Moreno, Cristina M. Villanueva, Paolo Peterlongo, Paolo Radice, M. M. Echeverry, A Vélez, Luis G. Carvajal‐Carmona, Rodney J. Scott, Steven Penegar, Peter Broderick, Albert Tenesa, Richard S. Houlston

Notice bibliographique

RevueBritish Journal of Cancer · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalCancer Care OntarioUniversity of OttawaUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesInstituto de Salud Carlos IIIUniversität GreifswaldXunta de GaliciaDeutsche KrebshilfeSiemensBundesministerium für Bildung und ForschungAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroFonds NutsOhraGrantová Agentura České RepublikyEuropean CommissionFondazione Italiana per la Ricerca sul CancroVetenskapsrådetOntario Institute for Cancer ResearchNational Health and Medical Research CouncilCancer Research UKUniversidad del TolimaSwedish Cancer FoundationNational Cancer InstituteKWF KankerbestrijdingMinistry of Cultural AffairsGenome Canada
Mots-clésPenetranceColorectal cancerCancer geneticsMultifactorial InheritanceCancerGeneticsInheritance (genetic algorithm)Human geneticsBiologyGenetic variantsMedicineOncologyBioinformaticsSingle-nucleotide polymorphismGenotypeGenePhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

It is now recognised that a part of the inherited risk of colorectal cancer (CRC) can be explained by the co-inheritance of low-penetrance genetic variants. The accumulated experience to date in identifying these variants has served to highlight difficulties in conducting statistically and methodologically rigorous studies and follow-up analyses. The COGENT (COlorectal cancer GENeTics) consortium includes 20 research groups in Europe, Australia, the Americas, China and Japan. The overarching goal of COGENT is to identify and characterise low-penetrance susceptibility variants for CRC through association-based analyses. In this study, we review the rationale for identifying low-penetrance variants for CRC and our proposed strategy for establishing COGENT.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,310
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations48
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBritish Journal of CancerMême sujetGenetic factors in colorectal cancerTravaux en français237 207