MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2150705064 · doi:10.1186/1758-3284-3-11

The association between EGFR variant III, HPV, p16, c-MET, EGFR gene copy number and response to EGFR inhibitors in patients with recurrent or metastatic squamous cell carcinoma of the head and neck

2011· article· en· W2150705064 sur OpenAlexafffund
Nicole G. Chau, Bayardo Perez‐Ordoñez, Katherine Zhang, Nhu‐An Pham, Jcm Ho, Tong Zhang, Olga Ludkovski, Lisa Wang, Eric X. Chen, Ming‐Sound Tsao, Suzanne Kamel‐Reid, Lillian L. Siu

Notice bibliographique

RevueHead & Neck Oncology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHead and Neck Cancer Studies
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesPfizer CanadaPfizer
Mots-clésErlotinibMedicineEpidermal growth factor receptorEGFR inhibitorsOncologyCancer researchImmunohistochemistryInternal medicineCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: We examine the potential prognostic and predictive roles of EGFR variant III mutation, EGFR gene copy number (GCN), human papillomavirus (HPV) infection, c-MET and p16INK4A protein expression in recurrent or metastatic squamous cell carcinoma of the head and neck (R/M SCCHN). METHODS: We analyzed the archival tumor specimens of 53 patients who were treated in 4 phase II trials for R/M SCCHN. Two trials involved the EGFR inhibitor erlotinib, and 2 trials involved non-EGFR targeted agents. EGFRvIII mutation was determined by quantitative RT-PCR, HPV DNA by Linear Array Genotyping, p16 and c-MET protein expression by immunohistochemistry, and EGFR GCN by FISH. RESULTS: EGFRvIII mutation, detected in 22 patients (42%), was associated with better disease control, but no difference was seen between erlotinib-treated versus non-erlotinib treated patients. EGFRvIII was not associated with TTP or OS. The presence of HPV DNA (38%), p16 immunostaining (32%), c-MET high expression (58%) and EGFR amplification (27%), were not associated with response, TTP or OS. CONCLUSION: EGFRvIII mutation, present in about 40% of SCCHN, appears to be an unexpected prognostic biomarker associated with better disease control in R/M SCCHN regardless of treatment with erlotinib. Larger prospective studies are required to validate its significance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations83
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueHead & Neck OncologyMême sujetHead and Neck Cancer StudiesTravaux en français237 207