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Enregistrement W2150853463 · doi:10.1242/bio.20134267

Inter-channel scaffolding of presynaptic CaV2.2 via the C terminal PDZ ligand domain

2013· article· en· W2150853463 sur OpenAlex
Sabiha R. Gardezi, Qi Li, Elise F. Stanley

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueBiology Open · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensToronto Western Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPDZ domainBiologySynaptic vesicleScaffold proteinSynaptosomeCell biologyActive zoneFusion proteinBiophysicsVesicleBiochemistryMembraneSignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Calcium entry through CaV2.2 calcium channels clustered at the active zone (AZ) of the presynaptic nerve terminal gates synaptic vesicle (SV) fusion and the discharge of neurotransmitters, but the mechanism of channel scaffolding remains poorly understood. Recent studies have implicated the binding of a PDZ ligand domain (PDZ-LD) at the tip of the channel C terminal to a partner PDZ domain on RIM1/2, a synaptic vesicle-associated protein. To explore CaV2.2 scaffolding, we created intracellular region fusion proteins and used these to test for binding by 'fishing' for native CaV2.2 channels from cell lysates. Fusion proteins mimicking the distal half of the channel C terminal (C3strep) reliably captured CaV2.2 from whole brain crude membrane or purified synaptosome membrane lysates, whereas channel I-II loop or the distal half of the II-III loop proteins were negative. This capture could be replicated in a non-synaptic environment using CaV2.2 expressed in a cell line. The distal tip PDZ-LD, DDWC-COOH, was confirmed as the critical binding site by block of pull-down with mimetic peptides. Pull-down experiments using brain crude membrane lysates confirmed that RIM1/2 can bind to the DDWC PDZ-LD. However, robust CaV2.2 capture was observed from synaptosome membrane or in the cell line expression system with little or no RIM1/2 co-capture. Thus, we conclude that CaV2.2 channels can scaffold to each other via an interaction that involves the PDZ-LD by an inter-channel linkage bridged by an unknown protein.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,124
Score d'incertitude au seuil0,310

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle