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Enregistrement W2151108285 · doi:10.1101/gad.1787109

Histone H2A.Z is essential for estrogen receptor signaling

2009· article· en· W2151108285 sur OpenAlexafffund
Nicolas Gévry, Sara Hardy, Pierre‐Étienne Jacques, Liette Laflamme, Amy Svotelis, François Robert, Luc Gaudreau

Notice bibliographique

RevueGenes & Development · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Chromatin Dynamics
Établissements canadiensUniversité de MontréalMontreal Clinical Research InstituteUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyChromatinEnhancerHistoneNucleosomeRegulation of gene expressionPromoterEstrogen receptorCell biologyGeneChIA-PETGene expressionEstrogen receptor alphaMolecular biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Incorporation of H2A.Z into the chromatin of inactive promoters has been shown to poise genes for their expression. Here we provide strong evidence that H2A.Z is incorporated into the promoter regions of estrogen receptor (ERalpha) target genes only upon gene induction, and that, in a cyclic pattern. Moreover, members of the human H2A.Z-depositing complex, p400, also follow the same gene recruitment kinetics as H2A.Z. Importantly, cellular depletion of H2A.Z or p400 leads to a severe defect in estrogen signaling, including loss of estrogen-specific cell proliferation. We find that incorporation of H2A.Z within TFF1 promoter chromatin allows nucleosomes to adopt preferential positions along the DNA translational axis. Finally, we provide evidence that H2A.Z is essential to allow estrogen-responsive enhancer function. Taken together, our results provide strong mechanistic insight into how H2A.Z regulates ERalpha-mediated gene expression and provide a novel link between H2A.Z-p400 and ERalpha-dependent gene regulation and enhancer function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations149
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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