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Enregistrement W2151802013 · doi:10.1095/biolreprod.107.062760

Alterations in Gene Expression in the Caput Epididymides of Nonobstructive Azoospermic Men1

2007· article· en· W2151802013 sur OpenAlexaff
Évemie Dubé, Louis Hermo, Peter Chan, Daniel G. Cyr

Notice bibliographique

RevueBiology of Reproduction · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSperm and Testicular Function
Établissements canadiensRoyal Victoria HospitalMcGill UniversityInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyEpididymisAzoospermiaAndrologyGeneCell biologyMale infertilitySpermatogenesisObstructive azoospermiaEndocrinologyOccludinGene expressionInternal medicineInfertilityGeneticsTight junctionSpermPregnancy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Spermatozoal maturation in the epididymis is dependent on proteins secreted by the epithelium and those that create the proper ionic composition and pH of the lumen as well as the blood-epididymal barrier. For the human epididymis, little information exists about the regulation of these proteins in male infertility. Our objectives were to assess gene expression profiles in the caput epididymidis from men with normal spermatogenesis and men with nonobstructive azoospermia. With microarrays, we identified 414 genes in the caput epididymidis that were differentially regulated in infertile men by at least 2-fold compared with the fertile men. They were mostly involved in transcription, intracellular signaling, immunity, and fertility. Although the expression of genes encoding tight junctional proteins was not affected, the localization of CLDN10 and TJP1, but not CLDNs 1, 3, and 8, was altered in infertile patients, suggesting that there are changes in the paracellular functions of the blood-epididymal barrier. Differentially regulated genes included several encoding proteins involved in spermatozoal maturation, water and ion channels, and beta-defensins: CRISP1, SPINLW1, FAM12B, and DEFB129 were upregulated, whereas CFTR, AQP5, KCNK4, KCNK17, SLC6A20, SLC13A3, DEFB126, and DEFB106A were downregulated. Furthermore, the immunolocalization of AQP5, but not of CFTR or CRISP1, varied in infertile and fertile patients. The observation that the expression of genes involved in water and ion transport were repressed in infertile patients suggests that these genes are regulated by the presence of testicular products or spermatozoa in the epididymal lumen or are part of a broader syndrome associated with nonobstructive azoospermia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations90
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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