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Enregistrement W2151850577 · doi:10.1128/jcm.01474-06

Phylogenetic Comparisons Reveal Multiple Acquisitions of the Toxin Genes by Enterotoxigenic <i>Escherichia coli</i> Strains of Different Evolutionary Lineages

2006· article· en· W2151850577 sur OpenAlexaff
Sue M. Turner, Roy R. Chaudhuri, Zhi‐Dong Jiang, Herbert L. DuPont, Carlton Gyles, Charles W. Penn, Mark J. Pallen, Ian R. Henderson

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Microbiology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensUniversity of GuelphInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilUniversity of BirminghamWellcome Trust
Mots-clésEnterotoxigenic Escherichia coliBiologyMicrobiologyVirulenceMultilocus sequence typingEscherichia coliDiarrheaPathogenPhylogenetic treeEnterotoxinToxinShiga toxinPathovarGeneGeneticsBacteriaGenotypePseudomonas aeruginosa

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Escherichia coli is a diverse bacterial species which is widely distributed in the environment but also exists as a commensal and pathogen of different host species. Human intestinal pathogenic E. coli causes over 160 million cases of diarrhea and an estimated 1 million deaths per year. The majority of deaths are attributable to one pathovar of E. coli, namely, enterotoxigenic E. coli. The pathogenesis of enterotoxigenic E. coli is dependent on the production of a colonization factor to promote adhesion to the intestinal epithelium and the elaboration of heat-labile or heat-stable toxins which induce a secretory diarrhea. Despite the high morbidity and mortality associated with enterotoxigenic E. coli infection, little is known of the genetic background of this global pathogen. Here we demonstrate by multilocus sequence typing that enterotoxigenic E. coli isolates are present in all phylogenetic lineages of E. coli, indicating that acquisition of the toxin genes may be sufficient to generate an enterotoxigenic E. coli strain. In addition, screening of diarrheal isolates for the presence of additional genes previously associated with the virulence of enterotoxigenic E. coli revealed that they were not abundant. These observations have significant implications for disease epidemiology and for the design of effective vaccines.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,305
Score d'incertitude au seuil0,510

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations84
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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