Phylogeny and adaptive radiation in the Onychopoda (Crustacea, Cladocera): evidence from multiple gene sequences
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Members of the order Cladocera show remarkable morphological and ecological diversity. One of the most spectacular adaptive radiations in this group has involved species of the suborder Onychopoda, which have adopted a novel feeding strategy, predation, and have colonized habitats with a broad range of salinities. In order to evaluate the origins and systematics of this group, we derived a molecular phylogeny for its three component families including nine of 10 recognized genera based on three mitochondrial (mt) gene sequences: cytochrome c oxidase subunit I (COI), the ribosomal small and large subunits (12S and 16S) and one nuclear gene sequence: the small ribosomal subunit (18S). Maximum-parsimony, maximum-likelihood and neighbour-joining phylogenetic analyses were largely congruent, supporting the monophyly of the suborder and each of its families. Comparative analyses of data based on total evidence and the conditional combination of the ribosomal genes produced relatively congruent patterns of phylogenetic affinity. By contrast, analyses of single gene results were inconsistent in recovering the monophyletic groups identified by the multigene analyses. Based on the reconstructed phylogeny, we discriminate among the existing hypotheses regarding the evolutionary history of the onychopods. We identify a prolonged episode of speciation from the Miocene to the Pleistocene with two pulses of diversification. We discuss our results with reference to the geological history of the Ponto-Caspian basin, the region which fostered the onychopod radiation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».