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Enregistrement W2152163646 · doi:10.1042/bj20030884

Proline residues in transmembrane segment IV are critical for activity, expression and targeting of the Na+/H+ exchanger isoform 1

2004· article· en· W2152163646 sur OpenAlexafffund
Emily R. Slepkov, Signy Chow, M. Joanne Lemieux, Larry Fliegel

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchBrock UniversityFondation pour la Recherche MédicaleHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésSodium–hydrogen antiporterTransmembrane domainGene isoformMutantTransmembrane proteinIntracellular pHProlineWild typeBiochemistryChemistryCell biologyIntracellularMutationMolecular biologyBiologyAmino acidSodiumGeneReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

NHE1 (Na+/H+ exchanger isoform 1) is a ubiquitously expressed integral membrane protein that regulates intracellular pH in mammalian cells. Proline residues within transmembrane segments have unusual properties, acting as helix breakers and increasing flexibility of membrane segments, since they lack an amide hydrogen. We examined the importance of three conserved proline residues in TM IV (transmembrane segment IV) of NHE1. Pro167 and Pro168 were mutated to Gly, Ala or Cys, and Pro178 was mutated to Ala. Pro168 and Pro178 mutant proteins were expressed at levels similar to wild-type NHE1 and were targeted to the plasma membrane. However, the mutants P167G (Pro167-->Gly), P167A and P167C were expressed at lower levels compared with wild-type NHE1, and a significant portion of P167G and P167C were retained intracellularly, possibly indicating induced changes in the structure of TM IV. P167G, P167C, P168A and P168C mutations abolished NHE activity, and P167A and P168G mutations caused markedly decreased activity. In contrast, the activity of the P178A mutant was not significantly different from that of wild-type NHE1. The results indicate that both Pro167 and Pro168 in TM IV of NHE1 are required for normal NHE activity. In addition, mutation of Pro167 affects the expression and membrane targeting of the exchanger. Thus both Pro167 and Pro168 are strictly required for NHE function and may play critical roles in the structure of TM IV of the NHE.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations90
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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