Correlation of the Capsular Phenotype in <i>Propionibacterium freudenreichii</i> with the Level of Expression of <i>gtf</i> , a Unique Polysaccharide Synthase-Encoding Gene
Notice bibliographique
Résumé
Many food-grade bacteria produce exopolysaccharides (EPS) that affect the texture of fermented food products and that may be involved in probiotic properties. Propionibacterium freudenreichii is a Gram-positive food-grade bacterium with reported probiotic capabilities that is widely used as starter in Swiss-type cheese. In this study, 68 strains of P. freudenreichii were screened for the beta-glucan capsular phenotype by immunoagglutination with a specific antibody and for the presence of the gtf gene coding for polysaccharide synthase. All strains were positive for PCR amplification with gtf gene-specific primers, but the presence of beta-glucan capsular EPS was detected for only 35% of the strains studied. Disruption of gtf in P. freudenreichii revealed that gtf is a unique gene involved in beta-glucan capsular EPS production in P. freudenreichii. The gtf gene was transferred into and expressed in Lactococcus lactis, in which it conferred an agglutination-positive phenotype. Expression of the gtf gene was measured by performing quantitative reverse transcription-PCR assays with RNA from four capsular and three noncapsular strains. A positive correlation was found between the beta-glucan capsular phenotype and gtf gene expression. Sequencing of the region upstream of the gtf open reading frame revealed the presence of an insertion element (IS element) in this upstream region in the four strains with the beta-glucan capsular phenotype. The role of the IS element in the expression of neighboring genes and its impact on interstrain variability of the P. freudenreichii capsule phenotype remain to be elucidated.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».