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Enregistrement W2152254495 · doi:10.1002/jgm.867

A convenient plasmid system for construction of helper‐dependent adenoviral vectors and its application for analysis of the breast‐cancer‐specific mammaglobin promoter

2006· article· en· W2152254495 sur OpenAlexaff
Chang‐Xin Shi, Frank L. Graham, Mary Hitt

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Gene Medicine · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVirus-based gene therapy research
Établissements canadiensUniversity of AlbertaMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMammaglobinEnhancerPlasmidVector (molecular biology)TransgeneBiologyViral vectorReporter geneExpression cassettePromoterComputational biologyMolecular biologyGeneGeneticsTranscription factorRecombinant DNAGene expressionBreast cancerCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Helper-dependent (HD) adenovirus (Ad) vectors, deleted of all viral coding sequences, have a higher cloning capacity, improved performance of tissue-specific promoters, and reduced toxicity in animals relative to first-generation Ad vectors, making these vectors promising tools for gene transfer in vitro and in vivo. However, the large size of HDAd precursor plasmids renders them relatively difficult to manipulate due to the paucity of unique restriction enzyme sites suitable for transgene insertion and to the size constraints imposed by the viral packaging machinery. METHODS: We have constructed a series of HDAd precursor plasmids that allows cassette insertion at a unique site in the vector backbone. We have tested whether these vector backbones will support the tissue-specificity of inserted expression cassettes in a study of the activity of the potentially breast-cancer-specific mammaglobin promoter and enhancer. RESULTS: We report here the generation of a series of HDAd precursor plasmids, both with and without an additional reporter expression cassette, that were designed to accommodate a wide range in size of inserted DNA. The system was validated for transcriptional targeting studies by demonstrating the tissue-specificity and activity of the mammaglobin promoter rescued using this precursor system. In addition, we have extended our previous studies on the mammaglobin promoter by demonstrating that two copies of the mammaglobin enhancer fused to the minimal promoter surpassed the activity of the single enhancer/promoter by at least 10-fold in breast cancer cells while maintaining only minimal expression in normal cells both in vitro and in a mouse tumor model. CONCLUSIONS: This versatile plasmid system simplifies the construction of HDAd vectors and was valuable in demonstrating the targeting potential of the mammaglobin promoter for breast cancer gene therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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