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Enregistrement W2152395868 · doi:10.1186/bcr3052

Common breast cancer susceptibility alleles are associated with tumour subtypes in BRCA1 and BRCA2 mutation carriers: results from the Consortium of Investigators of Modifiers of BRCA1/2

2011· article· en· W2152395868 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueBreast Cancer Research · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensCancer Care OntarioUniversité LavalUniversity of TorontoMount Sinai HospitalLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteCentre hospitalier universitaire de QuébecSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesHelen Diller Family Comprehensive Cancer Center, University of California, San FranciscoNational Cancer InstituteNational Health and Medical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchCancer Center, University of KansasFox Chase Cancer CenterZonMwCentre Léon BérardNational Institutes of HealthCentre Hospitalier Universitaire de NantesUniversiteit LeidenInstitut Claudius RegaudFondazione Italiana per la Ricerca sul CancroRadboud Universitair Medisch CentrumInstitut BergoniéDeutsche KrebshilfeLeids Universitair Medisch CentrumAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroRoyal Marsden NHS Foundation TrustUmeå UniversitetIstituto Oncologico VenetoU.S. Public Health ServiceLietuvos Mokslo TarybaLandspítali HáskólasjúkrahúsLunds UniversitetMinistero della SaluteUniversity of PennsylvaniaInstitut Gustave-RoussySahlgrenska UniversitetssjukhusetErasmus Medisch CentrumVrije Universiteit AmsterdamHuntsman Cancer InstituteCancer AustraliaNational Breast Cancer FoundationNational Institute for Health and Care ResearchAvon Foundation for WomenUniversitair Medisch Centrum GroningenDeutsches KrebsforschungszentrumLinköpings UniversitetAlleanza Contro il CancroCanadian Breast Cancer Research AllianceUniversity of California, San FranciscoCreighton UniversityHelsingin ja Uudenmaan SairaanhoitopiiriMedical Research CouncilUppsala UniversitetMemorial Sloan-Kettering Cancer CenterOhio State UniversityRadboud UniversiteitKansas Bioscience AuthorityAkademiska SjukhusetCancer Care OntarioKWF KankerbestrijdingCancer Research UKGeorgetown UniversityBreast Cancer Research Foundation
Mots-clésSurgical oncologyBreast cancerBRCA2 ProteinAlleleMedicineOncologyMutationCancer researchGeneticsCancerInternal medicineBiologyGermline mutationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Previous studies have demonstrated that common breast cancer susceptibility alleles are differentially associated with breast cancer risk for BRCA1 and/or BRCA2 mutation carriers. It is currently unknown how these alleles are associated with different breast cancer subtypes in BRCA1 and BRCA2 mutation carriers defined by estrogen (ER) or progesterone receptor (PR) status of the tumour. METHODS: We used genotype data on up to 11,421 BRCA1 and 7,080 BRCA2 carriers, of whom 4,310 had been affected with breast cancer and had information on either ER or PR status of the tumour, to assess the associations of 12 loci with breast cancer tumour characteristics. Associations were evaluated using a retrospective cohort approach. RESULTS: The results suggested stronger associations with ER-positive breast cancer than ER-negative for 11 loci in both BRCA1 and BRCA2 carriers. Among BRCA1 carriers, single nucleotide polymorphism (SNP) rs2981582 (FGFR2) exhibited the biggest difference based on ER status (per-allele hazard ratio (HR) for ER-positive = 1.35, 95% CI: 1.17 to 1.56 vs HR = 0.91, 95% CI: 0.85 to 0.98 for ER-negative, P-heterogeneity = 6.5 × 10-6). In contrast, SNP rs2046210 at 6q25.1 near ESR1 was primarily associated with ER-negative breast cancer risk for both BRCA1 and BRCA2 carriers. In BRCA2 carriers, SNPs in FGFR2, TOX3, LSP1, SLC4A7/NEK10, 5p12, 2q35, and 1p11.2 were significantly associated with ER-positive but not ER-negative disease. Similar results were observed when differentiating breast cancer cases by PR status. CONCLUSIONS: The associations of the 12 SNPs with risk for BRCA1 and BRCA2 carriers differ by ER-positive or ER-negative breast cancer status. The apparent differences in SNP associations between BRCA1 and BRCA2 carriers, and non-carriers, may be explicable by differences in the prevalence of tumour subtypes. As more risk modifying variants are identified, incorporating these associations into breast cancer subtype-specific risk models may improve clinical management for mutation carriers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,060
Score d'incertitude au seuil0,931

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle