Establishment of normal, terminally differentiating mouse erythroid progenitors: molecular characterization by cDNA arrays
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Expression profiling with cDNA arrays is an excellent tool for molecular analysis of complex processes such as terminal erythroid differentiation. The shortcomings of the currently available erythroid in vitro differentiation models, however, severely impaired the usefulness of this approach to study erythropoiesis. Here, we describe a novel, murine erythroid cell system closely corresponding to in vivo erythroid progenitors. Mortal, long‐term proliferating erythroid progenitors of fetal liver or immortal strains of p53‐deficient erythroblasts were established in culture. Both cell types proliferated in serum‐free medium and were strictly dependent on physiologically relevant cytokines and hormones, stably retaining a diploid set of chromosomes. If exposed to physiological differentiation factors (erythropoietin plus insulin), cells synchronously recapitulated the normal in vivo differentiation program to mature terminally into enucleated erythrocytes and expressed stage‐specific erythroid transcription factors in the expected temporal order. Using cDNA arrays, we found a large number of genes differentially expressed at time points during differentiation. Already 6 h after differentiation induction, 17% of the expressed genes showed significant alterations in mRNA abundance, increasing to 53% (12% up‐regulated, 41% down‐regulated genes) by 48 h. Cluster analysis of mRNA expression kinetics during differentiation identified six distinct expression patterns. All genes on the array with a known function in erythropoiesis showed the expected variations in expression. The genes identified also allowed first insights into the sequence of events within the regulatory network responsible for erythroid maturation. In mortal wild‐type as well as immortal p53 ‐/‐ erythroblasts, changes in mRNA abundance of several well‐regulated gene products was verified at the protein level. Taken together, this novel hematopoietic cell system faithfully executes essential steps of normal erythropoiesis and allows us to dissect and characterize molecular mechanisms involved in erythropoiesis.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».