Cells in shearable and nonshearable regions of<i>Salmonella enterica</i>serovar Enteritidis biofilms are morphologically and physiologically distinct
Notice bibliographique
Résumé
Cellular morphology, exopolymer chemistry, and protein expression of shearable and nonshearable fractions of Salmonella enterica serovar Enteritidis biofilms were examined. Biofilms were grown at a laminar flow velocity of 0.07 cm.s-1 for ~120 h, resulting in biofilms with a thickness (mean +/- SD) of 43 +/- 24 microm. An empirically determined shear-inducing flow (1.33 cm.s-1) was then applied for 5 min, effectively reducing biofilm thickness by ~70% and leaving 13 +/- 6 microm of nonshearable material and allowing fractionation of biofilm material into shearable and nonshearable regions. In situ lectin binding analyses revealed that there was no significant difference in the exopolymer glycoconjugate composition of the shearable and nonshearable biofilm zones. Length to width indices of cells from nonshearable and shearable biofilm regions as well as planktonic cells from biofilm effluent and continuous culture were determined to be 3.2, 2.3, 2.2, and 1.7, respectively, indicating that the cells in the shearable fraction were morphologically more similar to planktonic cells than the cells in the nonshearable biofilm fraction. Enhanced expression of proteins involved in cold shock response, adaptation, and broad regulatory functions (CspA, GrcA, and Hns, respectively) in cells from the shearable region as well as protein translation and modification and enhanced expression of protein involved in heat shock response and chaperonin function (DnaK) in cells from the nonshearable region revealed that the physiological status of cells in the two biofilm regions was distinct. This was also reflected in the different morphologies of cells from the two biofilm zones. Stratified patterns of cell metabolism and morphology in biofilms, obtained using shear-induced biofilm fractionation, may yield important information of how cells of deeply embedded biofilm bacteria survive imposed conditions of stress such as treatment with antimicrobial agents or antibiotics.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».