THE BRET<sup>2</sup>/ARRESTIN ASSAY IN STABLE RECOMBINANT CELLS: A PLATFORM TO SCREEN FOR COMPOUNDS THAT INTERACT WITH G PROTEIN-COUPLED RECEPTORS (GPCRS)*
Notice bibliographique
Résumé
In BRET2 (Bioluminescence Resonance Energy Transfer), a Renilla luciferase (RLuc) is used as the donor protein, while a Green Fluorescent Protein (GFP2) is used as the acceptor protein. In the presence of the cell permeable substrate DeepBlueC, RLuc emits blue light at 395 nm. If the GFP2 is brought into close proximity to RLuc via a specific biomolecular interaction, the GFP2 will absorb the blue light energy and reemit green light at 510nm. BRET2 signals are therefore easily determined by measuring the ratio of green over blue light (510/395nm) using appropriate dual channel luminometry instruments (e.g., Fusion Universal Microplate Analyzer, Packard BioScience). Since no light source is required for BRET2 assays, the technology does not suffer from high fluorescent background or photobleaching, the common problems associated with standard FRET-based assays. Using BRET2, we developed a generic G Protein-Coupled Receptor (GPCR) assay based on the observation that activation of the majority of GPCRs by agonists leads to the interaction of beta-arrestin (a protein that is involved in receptor desensitization and sequestration) with the receptor. We established a cell line stably expressing the GFP2:beta-arrestin 2 fusion protein, and showed that it can be used to monitor the activation of various transiently expressed GPCRs, in BRET2/arrestin assays. In addition, using the HEK 293/GFP2:beta-arrestin 2 cell line as a recipient, we generated a double-stable line co-expressing the vasopressin 2 receptor (V2R) fused to RLuc (V2R:RLuc) and used it for the pharmacological characterization of compounds in BRET2/arrestin assays. This approach yields genuine pharmacology and supports the BRET2/arrestin assay as a tool that can be used with recombinant cell lines to characterize ligand-GPCR interactions which can be applied to ligand identification for orphan receptors.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,004 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,004 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,004 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,005 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».