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Enregistrement W2154192760 · doi:10.1002/bit.20428

Transient gene expression in HEK293 cells: Peptone addition posttransfection improves recombinant protein synthesis

2005· article· en· W2154192760 sur OpenAlexaff
Phuong Lan Pham, Sylvie Perret, Brian Cass, Éric Le Carpentier, G. J. St-Laurent, Louis Bisson, Amine Kamen, Yves Durocher

Notice bibliographique

RevueBiotechnology and Bioengineering · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueViral Infectious Diseases and Gene Expression in Insects
Établissements canadiensNational Research Council CanadaBiotechnology Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGreen fluorescent proteinBiochemistryValineAmino acidRecombinant DNAProtein biosynthesisTransfectionLeucineAsparagineChemistryGene expressionCaseinGlycineMolecular biologyGeneBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gene expression by large-scale transfection of mammalian cells is becoming an established technology for the fast production of milligram and even gram amounts of recombinant proteins (r-proteins). However, efforts are still needed to optimize production parameters in order to maximize volumetric productivities while maintaining product quality. In this study, transfection efficiency and volumetric productivity following transient gene expression in HEK293 cells were evaluated using green fluorescent protein (GFP) and human placental secreted alkaline phosphatase (SEAP) as reporter genes. We show that a single pulse of peptones (protein hydrolysates) to the cultures performed in a low serum (1%, v/v) and in serum-free medium results in a significant increase in volumetric protein productivity. Sixteen peptones from different sources were tested and almost all of them showed a positive effect on r-protein production. This effect, however, is time- and concentration-dependent. By using Tryptone N1 (a casein peptone, TN1) to feed the cultures at 24 h posttransfection (hpt), a 2-fold increase in volumetric SEAP productivity was obtained 5 days posttransfection. This effect was shown to be equal to that obtained when the culture was fed with a supplementary 4% (v/v) of serum. The positive effect of TN1 on protein production was also demonstrated with Tie2 protein ectodomain produced in serum-free medium. HPLC analysis of amino acids consumption/production during control batch and TN1 pulse culture showed some major differences in amino acid metabolism when using TN1 pulse. Asparagine, glycine, histidine, threonine, leucine, and valine show accumulation in the medium over the cultivation period instead of being consumed as observed in unfed sample (except for asparagine, which remained unchanged). Isoleucine, tyrosine, methionine, and phenylalanine all remained unchanged or slightly fluctuated in TN1-fed culture after the feeding pulse, while they were all steadily consumed in the control run. The relative abundance of SEAP's mRNA suggests that the improvement in protein yield results both from an increase of the translational activity and transcription efficiency. Further understanding of mechanisms by which amino acids/peptides regulate transcriptional and translational machinery in mammalian cells should facilitate the design of new strategies for the improvement of r-protein production by large-scale transfection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations115
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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