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Enregistrement W2154718868 · doi:10.1128/aac.44.3.528-532.2000

<i>pncA</i> Mutations as a Major Mechanism of Pyrazinamide Resistance in <i>Mycobacterium tuberculosis</i> : Spread of a Monoresistant Strain in Quebec, Canada

2000· article· en· W2154718868 sur OpenAlexaffabout
Shao-Ji Cheng, Louise Thibert, Tracy Sanchez, Leonid Heifets, Ying Zhang

Notice bibliographique

RevueAntimicrobial Agents and Chemotherapy · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensSte. Anne's Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthPotts Memorial Foundation
Mots-clésPyrazinamideMycobacterium tuberculosisBiologyMutationDrug resistanceMicrobiologyGeneticsGeneTuberculosisMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pyrazinamide (PZA) is an important first-line tuberculosis drug that is part of the currently used short-course tuberculosis chemotherapy. PZA is a prodrug that has to be converted to the active form pyrazinoic acid by pyrazinamidase (PZase) activity, encoded by the pncA gene of Mycobacterium tuberculosis, and loss of PZase activity is associated with PZA resistance. To further define the genetic basis of PZA resistance and determine the frequency of PZA-resistant strains having pncA mutations, we sequenced the pncA gene from a panel of 59 PZA-resistant clinical isolates from Canada, the United States, and Korea. Two strains that did not contain pncA mutations and had positive PZase turned out to be falsely resistant. Three PZase-negative strains (MIC, >900 microgram of PZA per ml) and one PZase-positive strain (strain 9739) (MIC, >300 microgram of PZA per ml) did not have pncA mutations. The remaining 53 of the 57 PZA-resistant isolates had pncA mutations, confirming that pncA mutation is the major mechanism of PZA resistance. Various new and diverse mutations were found in the pncA gene. Interestingly, 20 PZA-monoresistant strains and 1 multidrug-resistant isolate from Quebec, Canada, all had the same pncA mutation profile, consisting of an 8-nucleotide deletion and an amino acid substitution of Arg140-->Ser. Strain typing indicated that these strains are highly related and share almost identical IS6110 patterns. These data strongly suggest the spread of a PZA-monoresistant strain, which has not previously been described.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,735
Score d'incertitude au seuil0,706

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations172
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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