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Enregistrement W2154959108 · doi:10.1093/hmg/ddm383

Polycystin-2 is regulated by endoplasmic reticulum-associated degradation

2008· article· en· W2154959108 sur OpenAlexaff
Guanxiang Liang, Qiaomu Li, Yan Tang, Koichi Kokame, Takashi Kikuchi, GuanPing WU, X.-Z. Chen

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Kidney Cyst Diseases
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEndoplasmic reticulumBiologyCell biologyDegradation (telecommunications)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Endoplasmic reticulum(ER)-associated degradation (ERAD) is an essential process for cell homeostasis and remains not well understood. During ERAD, misfolded proteins are recognized, ubiquitinated on ER and subsequently retro-translocated/dislocated from ER to the 26S proteasome in the cytosol for proteolytic elimination. Polycystin-2 (PC2), a member of the transient receptor potential superfamily of cation channels, is a Ca channel mainly located on ER and primary cilium membranes of cells. Mutations in PC2 are associated with autosomal dominant polycystic kidney disease (ADPKD). The cellular and molecular mechanisms underlying the PC2-associated pathogenesis remain unclear. Here we show that PC2 degradation is regulated by the ERAD pathway through the ubiquitin-proteasome system. PC2 interacted with ATPase p97, a well-known ERAD component extracting substrates from ER, and immobilized it in perinuclear regions. PC2 also interacted with Herp, an ubiquitin-like protein implicated in regulation of ERAD. We found that Herp is required for and promotes PC2 degradation. ER stress accelerates the retro-translocation of PC2 for cytosolic degradation, at least in part through increasing the Herp expression. Thus, PC2 is a novel ERAD substrate. Herp also promoted, to varied degrees, the degradation of PC2 truncation mutants, including two pathogenic mutants R872X and E837X, as long as they interact with Herp. In contrast, Herp did not interact with, and has no effect on the degradation of, PC2 mutant missing both the N- and C-termini. The ERAD machinery may thus be important for ADPKD pathogenesis because the regulation of PC2 expression by the ERAD pathway is altered by mutations in PC2.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,033
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations61
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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