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Enregistrement W2155018177 · doi:10.1093/toxsci/kfs177

Subchronic Oral Exposure to Benzo(a)pyrene Leads to Distinct Transcriptomic Changes in the Lungs That Are Related to Carcinogenesis

2012· article· en· W2155018177 sur OpenAlexafffund
Sarah Labib, Carole L. Yauk, Andrew Williams, Volker M. Arlt, David H. Phillips, Paul A. White, Sabina Halappanavar

Notice bibliographique

RevueToxicological Sciences · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCarcinogens and Genotoxicity Assessment
Établissements canadiensHealth Canada
Organismes subventionnairesHealth CanadaCancer Research UK
Mots-clésBenzo(a)pyreneCarcinogenesisCarcinogenTranscriptomeBiologyDNA damageMutantGeneMolecular biologyGene expressionTransgeneDNA adductCancer researchDNAGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have previously shown that acute oral exposure to the environmental carcinogen benzo(a)pyrene (BaP) elicits comparable levels of DNA adducts, but distinct transcriptomic changes, in mouse lungs and livers, the two main BaP bioactivating organs. Oral BaP exposure is predominantly associated with lung cancer and not hepatic cancer in some animal models, suggesting that gene expression differences may provide insight into the drivers of tissue-specific carcinogenesis. In the present study, we examine pulmonary DNA adduct formation, lacZ mutant frequency, and mRNA profiles in adult male MutaMouse following subchronic (28 day) oral exposure to BaP (0, 25, 50, and 75 mg/kg/day) and sacrificed 3 days postexposure. The results are compared with those obtained from livers of the same mice (previously published). Although there was a 1.8- to 3.3-fold increase in the levels of DNA adducts in lung compared with liver, the lacZ transgene mutant frequency was similar in both tissues. At the transcriptomic level, a transition from activation of the DNA damage response p53 pathway at the low dose to the induction of genes involved in angiogenesis, evasion of apoptosis and growth signals at the high doses was evident only in the lungs. These results suggest that tissue DNA adducts and mutant frequency are sensitive markers of target tissue exposure and mode of action, whereas early changes in gene expression may provide a better indication of the likelihood of carcinogenic transformation in selected tissues. Moreover, the study provides new information on the underlying mechanisms that contribute to tissue-specific responses to BaP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,587
Score d'incertitude au seuil0,557

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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