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Enregistrement W2155021672 · doi:10.1111/j.1364-3703.2007.00457.x

Role of a xyloglucan‐specific endo‐β‐1,4‐glucanase inhibitor in the interactions of <i>Nicotiana benthamiana</i> with <i>Colletotrichum destructivum</i> , <i>C. orbiculare</i> or <i>Pseudomonas syringae</i> pv. <i>tabaci</i>

2008· article· en· W2155021672 sur OpenAlexaff
Wanzhuo Xie, Lixin Hao, Paul H. Goodwin

Notice bibliographique

RevueMolecular Plant Pathology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesGenome Center, University of California, DavisUniversity of California, Davis
Mots-clésPseudomonas syringaeNicotiana benthamianaXyloglucanBiologyMicrobiologyHypersensitive responseGene silencingGlucanaseNicotianaGeneBotanyPathogenPlant disease resistanceCell wallSolanaceaeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanase inhibitor cDNA, NbXEGIP1, was amplified from diseased leaves of Nicotiana benthamiana. The sequence was similar to the tomato xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanase inhibitor (XEGIP) and tobacco nectarin IV genes that have been described as binding and inactivating fungal Family 12 xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanases. Expression of NbXEGIP1 was not detected in healthy leaves, but the gene was induced during the later stages of infection by the fungi Colletotrichum destructivum and C. orbiculare. Induction of NbXEGIP1 also occurred during disease development by the bacterium Pseudomonas syringae pv. tabaci and during the hypersensitive response produced by P. syringae pv. tabaci expressing avrPto. A portion of NbXEGIP1 was cloned into a tobacco rattle virus vector for virus-induced gene silencing in N. benthamiana. Silencing NbXEGIP1 did not affect the interactions with either Colletotrichum species but did significantly reduce population levels of P. syringae pv. tabaci in the compatible interaction and P. syringae pv. tabaci expressing avrPto in the incompatible interaction. In the susceptible response to P. syringae pv. tabaci, silencing of NbXEGIP1 also resulted in visibly wilted leaves several hours prior to necrosis, which was not observed in control plants. This was related to a significantly higher level of electrolyte leakage and higher expression of a defensin gene from infected NbXEGIP1-silenced leaves compared with control leaves. Silencing appeared to be specific as it did not affect expression of a related gene, NbXEGIP2. NbXEGIP1 may act as an inhibitor of a bacterial enzyme that degrades the xyloglucan-cellulose plant cell-wall network, and degradation of the cell wall results in host membrane disruption and signalling of defence responses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,077
Score d'incertitude au seuil0,605

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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