A fast, reproducible and low‐cost method for sequence deconvolution of ‘on‐bead’ peptides via ‘on‐target’ maldi‐TOF/TOF mass spectrometry
Notice bibliographique
Résumé
A novel approach to high-throughput sequence deconvolution of on-bead small peptides (MW < 2000 Da) using on-target MALDI-TOF/TOF instrumentation is presented. Short peptides of pentamer and octamer length, covalently attached to TentaGel polystyrene beads through a photolabile linker, were placed onto the MALDI target, apportioned with suitable matrix (2,5-dihydroxybenzoic acid) and then hit with the instrument laser (Nd : YAG, 355 nm). This induced easy and highly reproducible photochemical cleavage, desorption (MS mode) and fragmentation (MS/MS mode). Peptide fragments were identified with a mass accuracy of 0.1 Da of the expected values. This technique significantly accelerates the sequence determination of positive peptide hits obtained from random combinatorial libraries when screening against biological targets, paving the way for a rapid and efficient method to identify molecular imaging ligands specific to pathological targets in cancer and other diseases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».