<i>Potato virus M</i> in Bittersweet Nightshade (<i>Solanum dulcamara</i>) in New York State
Notice bibliographique
Résumé
Potato virus M (PVM) was detected in upstate New York in two plants of the widely naturalized, weedy perennial Solanum dulcamara. The virus was detected with a macroarray assay for potato viruses (1). Amplified, complimentary DNAs from the two isolates hybridized to 5 and 7 of the 15 oligonucleotide probes for PVM. Testing of the samples by double-antibody sandwich-ELISA using PVM-specific antibodies (Agdia, Elkhart, IN) showed a clear positive result. Sequence information for a 118-bp genomic region was obtained by amplification using carlavirus-specific primers (2) (GenBank Accession No. HQ446853). Comparison with a reference PVM genome (GenBank Accession No. NC_001361) showed that the sequence corresponded to nucleotide positions 8418 to 8533 with 86% identity. The infected plants were symptomless and collected from two sites, 50 miles apart. One site was a weedy roadside location in Tompkins County in 2009, while the second was from a hedgerow in a (non-potato) vegetable production area of Ontario County in 2010. The virus could be detected throughout the growing season in this perennial host. PVM was reported from S. dulcamara L. in Hungary and described as being found frequently from a diversity of habitats (3). Importantly, the virus was transmitted via tubers and by Myzus persicae with low efficiency (3). These results suggest that the virus may be endemic in S. dulcamara in the northeastern United States and this host may serve as a reservoir for the virus from which it could move into potato. To our knowledge, PVM has not been reported in this host in North America. References: (1) B. Agindotan and K. L. Perry. Plant Dis. 92:730, 2008. (2) J. Badge et al. Eur. J. Plant Pathol. 102:305, 1996. (3) P. Salamon. Eur. Assoc. Pot. Res. Virol. Sect. Meet. 42:121, 2006.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».